név: Dr. Kothalawala William Jayasekara
téma: Egyes sejtes transzkriptomikai adathalmazok integrált elemzése vastagbél- és emlődaganatokban
témavezető: Prof. Dr. Győrffy Balázs
kutatási téma rövid összefoglalása: Kutatásaim során nyílt hozzáférésű adatbázisokon elérhető egyes sejtes transzkriptomikai (single-cell RNA-seq) adathalmazok feldolgozásával, integrálásával és analízisével foglalkozom. Célom, hogy emlő- és vastagbéltumoros mintákból nagy mintaszámú, több százezer normál és tumoros sejtet is tartalmazó atlaszt hozzak létre. A tervezett atlasz lehetővé teszi kutatók számára, hogy vizsgálják a sejttípusok összetételét a daganattípusokban, valamint különböző összehasonlításokat végezzenek, például differenciálgénexpresszió vizsgálata normál és tumoros szövet, illetve a sejttípusok csoportjai között.
közlemények listája:
Kothalawala, William Jayasekara, and Balázs Győrffy. „Transcriptomic and cellular content analysis of colorectal cancer by combining multiple independent cohorts.” Clinical and Translational Gastroenterology (2022): 10-14309.
Kothalawala, William J., et al. „A Detailed Overview About the Single-Cell Analyses of Solid Tumors Focusing on Colorectal Cancer.” Pathology and Oncology Research (2022): 74.
Zsigrai, Sára, et al. „Folic Acid Treatment Directly Influences the Genetic and Epigenetic Regulation along with the Associated Cellular Maintenance Processes of HT-29 and SW480 Colorectal Cancer Cell Lines.” Cancers 14.7 (2022): 1820.