Az Annals of Oncology című, mintegy 65-ös impaktfaktorú, a világ vezető onkológiai folyóiratai közé tartozó nemzetközi szaklapban Prof. Dr. Győrffy Balázs, tanszékünk vezetőjének közreműködésével megjelent tanulmányban olyan bioinformatikai elemzésekhez járultunk hozzá, amelyek segíthetnek előre jelezni, kik profitálhatnak leginkább az immunterápiával kombinált kemoterápiából a tripla negatív emlőrák kezelésében. A NeoTRIPaPDL1 klinikai vizsgálat eredményeire épülő kutatás a daganat hosszú távú transzkriptomikai profilozását alkalmazta, vagyis azt vizsgálta, miként változik a daganat génexpressziós mintázata a kezelés különböző időpontjaiban.
A kutatás bioinformatikai szempontból különösen jelentős, hiszen nagy mennyiségű molekuláris adat időbeli összehasonlításával kerestünk olyan mintázatokat, amelyek előre jelezhetik a kezelés sikerességét. Az elemzések rámutattak, hogy bizonyos, már a kezelés előtt jelen lévő proliferációs és metabolikus génexpressziós mintázatok összefüggnek a terápiás válasszal, míg a kezelés során megfigyelhető immunaktiváció és a tumorsejtek korai eltűnése erős előrejelzője lehet a teljes patológiai válasznak. A longitudinális transzkriptomikai elemzések révén azt is feltárhattuk, hogyan alakul át a daganat mikrokörnyezete a terápia hatására.
Eredményeink hozzájárulhatnak ahhoz, hogy a jövőben pontosabban azonosíthassuk azokat a betegeket, akik a legtöbbet profitálhatnak a neoadjuváns kemoimmunoterápiából. Tanszékünk számára különösen fontos, hogy a bioinformatikai módszerek révén olyan prediktív biomarkereket azonosítsunk, amelyek közelebb vihetnek a személyre szabott daganatkezelés megvalósításához.
Innen lehet letölteni a cikket.
