A proteomikában jelenleg alkalmazott módszerek elsősorban a fehérjék szintjének mérésére összpontosítanak, de nem sok erőfeszítést tettek olyan megközelítések kifejlesztésére, amelyek egyszerre képesek a fehérjék és a fehérjék mennyiségének változását nyomon követni. A fehérjéknek különböző változatai lehetnek különböző immunogén epitópokkal, amelyek monoklonális antitestekkel kimutathatók. Ezek az epitópok olyan tényezők miatt változhatnak, mint az alternatív splicing, a módosítások, a degradáció és a komplexképződés, és gyakran szolgálnak kölcsönhatások helyszíneiként és különböző funkciókat látnak el. Ezért valószínű, hogy a specifikus hozzáférhető epitópok jelenléte korrelál a fehérje funkciójával normális és beteg állapotokban. Ebben a tanulmányban a kutatók egy új módszert mutatnak be, a fehérjeepitom-profilozás (PEP) nevű módszert a plazma immunogén epitópjainak elemzésére. Olyan monoklonális antitestek könyvtárát hozták létre, amelyek emberi plazmafehérjék különböző epitópjaival reagálnak. Egészséges egyének és rákos betegek plazmamintáinak szűrésével az epitópok különböző paneljeit azonosították, amelyek nagy pontossággal és specifikusan mutatták ki a tüdő-, emlő- és vastagbélrákot. A további elemzés részletes információkat tárt fel több száz epitóp expressziójáról, és lehetővé tette a tüdőrákkal összefüggő specifikus epitópok azonosítását. A kiválasztott biomarker epitópokat független klinikai vizsgálatokban validálták, bizonyítva a PEP-ben rejlő potenciált, mint a diagnosztikában használt fehérje biomarkerek értékes forrását.
A teljes közlemény, melynek címe „ A nagyméretű plazma-proteom epitomprofilalkotás hatékony eszköz a rákos biomarkerek felfedezésében” ide kattintva érhető el.