A Semmelweis Egyetem Bioinformatika Tanszéke tanulmányi versenyt hirdet egy bioinformatikai probléma megoldására.

A verseny során a cél a taxán (paclitaxel és docetaxel) tartalmú terápiát előre jelezni képes génexpressziós mintázat azonosítása rosszindulatú tumoros sejtvonalakban. A feladathoz tartozó adatbázis a tumoros sejtvonalak génexpressziós adatait, a terápia kimenetét (terápia rezisztens / terápia szenzitív) tartalmazza.  

Az alkalmazott megoldás, illetve eszközök lehetnek:

  • tetszőleges statisztikai módszer vagy mesterséges intelligencia algoritmus
  • MS Excel /SPSS
  • Galaxy platform
  • R statisztikai programcsomagok
  • Python

Jelentkezés:

A jelentkezés e-mailben történik név és NEPTUN-kód elküldésével a bioinformatika@med.semmelweis-univ.hu címre. A jelentkezők a bemeneti adatokat e-mailben kapják meg.

Jelentkezési határidő: 2023. 02. 28.

A beadott munkának tartalmaznia kell:

  • a megoldás forráskódja vagy algoritmusa
  • szöveges dokumentáció (maximum három A4-es oldal)

Beadási határidő: 2023.04.30.

Eredményhirdetés: 2023. május 15.

Értékelés:
A beküldött megoldások rangsorolása a beküldött szöveges dokumentáció minősége és a forráskód reprodukálhatósága alapján történik.

Díjak:

  1. hely: nemzetközi bioinformatikai továbbképzésen vagy konferencián való részvétel.
  2. hely: hazai bioinformatikai továbbképzésen vagy konferencián való részvétel.
  • Az első helyezett nemzetközi (Európai Unió), a második helyezett hazai bioinformatikai kurzust az Elixir Europe illetve Elixir Magyarország honlapjáról választhat:
  • A választott kurzus időtartama maximum 6 nap lehet. 
  • A nyeremény fedezi a regisztrációs díjat, valamint személyes részvétel esetén az utazás és a szállás költségét. (A választott szálloda maximum háromcsillagos.)
  1. Az 1-3. helyezettek a Klinikai Bioinformatika tárgy felvétele esetén megajánlott jeles gyakorlati jegyet kapnak.

Minden versenyzőnek sikeres munkát kívánunk!                                                                  

Prof. Dr. Győrffy Balázs és Dr. Fekete János Tibor

Kapcsolat: 

Dr. Fekete János Tibor                                                                                                    email: fekete.janos@med.semmelweisuniv.hu                                                                               tel.: +36 20 770 0513