A rangos Journal of Pharmaceutical Analysis folyóirat (IF 2023: 6,1) elfogadta Menyhart Otília, Kothalawala William és Győrffy Balázs „A gene set enrichment analysis for the cancer hallmarks” című közleményét
A tumorokban található nagy diverzitás ellenére közös szerveződési elvek jellemzik a rákos daganatokat. Ilyen szerveződési elvek például a szöveti invázió és áttétképzés, a megváltozott anyagcsere, a sejthalál elkerülése, az új vérerek képződése, vagy a korlát nélküli sejtosztódás. Elméletben ezek a szerveződési elvek és a hozzájuk kapcsolódó génkészletek ígéretes keretet nyújtanak a rák egységes tanulmányozására, azonban ezt jelentősen megnehezíti egy konszenzuson alapuló, az adott rák jellemzőkre (“hallmarkokra”) specifikus génkészlet hiánya.
A szerzők a rák jellemzőinek jobb megértése érdekében ezekhez a szerveződési elvekhez tartozó specifikus génkészletek meghatározását tűzték ki célul. Ennek érdekében hét különböző projekt eredményeit egyesítették, és tíz rákspecifikus jellemzőhöz kapcsolódó 6 763 gént azonosítottak.
Ez az átfogó génkészlet lehetőséget nyújt a különböző daganatos megbetegedések kialakulásának és előrehaladásának mélyebb megértéséhez. A szerzők által létrehozott szabadon elérhető online felület (www.cancerhallmarks.com) lehetővé teszi a génkészlet automatikus elemzését. Ez hasznos eszköz lehet minden kutató számára, hiszen tetszőleges génlistákból képes meghatározni, mely rákspiecifikus jellemzők vannak túlsúlyban a felületre feltöltött génlistában, és adott tumor típusok esetében mely szerveződési elvek kapják a legnagyobb hangsúlyt.
A teljes cikk ide kattintva érhető el.