Órarend
Órák: csütörtök, 16:00 – 17:30
A kurzus első órája: 2024/09/12
Helyszíne: Élettani intézet könyvtára (EOK, „A” fésű, 3. emelet), illetve a Zoom rendszer (online), a link a Moodle rendszeren keresztül érhető el.
Az előadásokról felvétel készül ami követhető élőben, illetve később visszanézhető a Moodle rendszerben.
Leírás
A kurzus folyamán a hallgatók megismerkednek a bioinformatikában, biostatisztikában és adatelemzésben elterjedten használt Python programozási nyelvvel, valamint a kutatási projektek és kísérletes adatok megfelelő menedzselésével. Ez a nyelv széles körben használt az általános “data science”, valamint a bioinformatika és a biostatisztika területén is. A kurzus sikeres elvégzéséhez előzetes programozási ismeretekre nincs szükség. A tavaszi félévben ,,Adatelemzés és programozás orvos biológusoknak II.” címmel a tanultakra építve komolyabb adatelemzési, adatvizualizálási módszerek elsajátítására is lesz lehetőség.
A kurzus problémaorientált, a nyelvek elemeit egyszerű példákon keresztül tanulják a diákok. Később valódi biológiai adatsorokon dolgozva tanulják meg az összetettebb feladatok megoldását. A kurzus során a tananyaghoz kapcsolódó heti feladatokat kapnak, amiket következő alkalommal megbeszélünk. Az értékelés a beadott feladatok alapján történik. A kurzus eredményes elvégzése a hallgatók részéről heti 1 – 2 óra gyakorlást igényel az órai munkán kívül.
A kurzus 14 gyakorlatból áll, heti egy-egy alkalommal 90 perces időtartamban. A kurzus elvégzéséhez szükség van számítógépre, erről a hallgatóknak maguknak kell gondoskodniuk, valamint Google belépésre is szükségük lesz. A gyakorlatokat Cserző Miklós tartja:
— Python alapok —
- Python alapok – Google colab felület, változók, függvények, metódusok
- Python alapok – adatok elérése (I/O)
- Python alapok – listák, ciklusok
- Python alapok – logikai változók, elágazások
- Python alapok – szótárak, felhasználói függvények
- Python alapok – összefoglalás
- Python alapok – gyakorlás
— Moduláris Python —
- PANDAS – CSV adatok
- Matplotlib – ábrázolás
- PANDAS – Excel adatok
- PANDAS – PDB szűrés, grafikus megoldás
- PANDAS – PDB szűrés, numerikus megoldás
- Python adatelemzés – összefoglalás
- A kurzus összefoglalása