Az intézetben folyó érpatológiai alapkutatás eredményeinek nemzetközi elismertségét jelenti, hogy a klinika részt vett a WHO által koordinált, 10 éves nemzetközi vizsgálatban, mely a fiatalkori atherosclerosis (érelmeszesedés) patológiai tényezőit vizsgálata. 2000-től kiterjedt nemzetközi kollaborációban jelentős humán és experimentális hepatológiai kutatások indultak, elsősorban a vírusdiagnosztika és a daganatok területén.
Az intézet kutatási tevékenységét jelenleg is több elnyert tudományos pályázat támogatja, köztük a Nemzeti Kutatási, Fejlesztési és Innovációs Hivatal pályázatai, melyek segítségével a betegségek kialakulását kutatják az intézetben. A főbb kutatási területek közé tartozik az angiogenezis (új erek alkotása vagy keletkezése), áttétképzés, melanóma, máj-, emlő- és hasnyálmirigy patológia.
Intézetünkben az alábbi munkacsoportok vezetésével zajlanak kutatások:
- Emlő munkacsoport
- Felső tápcsatornai és molekuláris daganatpatológiai munkacsoport
- Perinatális és placenta munkacsoport
- Tömegspektometriás munkacsoport
- Tumorimmunológiai munkacsoport
- Tumorprogressziós munkacsoport
- Vesepatológia munkacsoport