A tárgy áttekinti a fehérjék (biologikumok, bioszimiláris készítmények) primer, szekunder, tercier és kvaterner szerkezetének meghatározására használt mintaelőkészítési (emésztés, dúsítás), elválasztástechnikai (kromatográfia, elektroforézis) és spektroszkópiai módszereket (MS, NMR, CD, ESR, fluoreszcencia, röntgendiffrakció), ill. betekintést ad a mennyiségi meghatározás, a fehérje komplexek, fehérje modellezés, bioinformatika és fehérje hálózatok területén elért legújabb kutatási eredményekbe.
Tematika:
- Definíciók, szerkezet, tulajdonságok
- Fehérje gyógyszerek előállítása, minőségellenőrzése
- Mintaelőkészítés: extrakció, sejtek feltárása, szolubilizálás, emésztés, tisztítás/dúsítás. Kromatográfiás módszerek: SEC, IEX, RP-HPLC (UHPLC és nanoLC), HILIC, HIC.
- Fehérjék vizsgálata gél és kapilláris elektroforézissel.
- Fehérjék vizsgálata spektroszkópiás módszerekkel: fluoreszcencia, UV-VIS, infravörös, CD, ESR. Kétdimenziós kromatográfia (gél, HPLC); CE-LIF, HPLC-CD; fényszórás-fluoreszcencia-UV.
- Tömegspektrometria: LC-MS, MALDI-MS, imaging, lab-on-a-chip
- Fehérjeszekvencia meghatározás: bottom up/top down, peptidszekvencia meghatározás, poszttranszlációs módosulások (glikoziláció, foszforiláció); adatbázisok, szoftverek.
- Mágneses magrezonancia analízis: fehérjék szerkezet analízisére használt speciális NMR technikák (homonukleáris és heteronukleáris technikák)
- Speciális vizsgálatok NMR technikával: felgombolyodás (folding), kötődés, dinamikai vizsgálatok.
- Fehérje szerkezet meghatározás röntgendiffrakciós technikával.
- Fehérje konformáció és kölcsönhatások vizsgálata: fehérje komplexek (fehérje-fehérje, fehérje-ligandum), konformerek.
- Fehérjék kvantitatív meghatározása: gélalapú, jelölésmentes, izotópjelzéses technikák.
- Fehérjemodellezés. Bioinformatika.
- Proteomika.. Fehérje hálózatok vizsgálata.