A téma címe:
Endotélsejtek génexpressziós mintázatának vizsgálata
Témavezető neve:
Kiszel Petra, tudományos főmunkatárs
Témavezető elérhetősége:
kiszel.petra.mta@gmail.com
A témát meghirdető intézet:
Belgyógyászati és Hematológiai Klinika, Kutatólaboratórium
Az alábbi kar(ok)ról jelentkezhetnek hallgatók:
ÁOK, GYTK
Az alábbi évfolyam(ok)ról jelentkezhetnek hallgatók:
2. évfolyam, 3. évfolyam, 4. évfolyam
A téma ismertetése, fontos tudnivalók:
„Kérdésünk, hogy mi befolyásolja leginkább az endotélsejtek génexpressziós mintázatát, a környezet (esetünkben sejttenyésztő médium), vagy a sejtek genetikai háttere? Ehhez különböző endotélsejt vonalakat tenyésztünk in vitro rendszerben, többféle sejttenyésztő médiumban, majd a génexpressziós mintázatot Agilent microarray-vel vizsgáljuk.”
A témához kapcsolódó hallgatói feladatok és követelmények:
„Feladatok:
Nagymennyiségű adatok előkészítése problémaorientált kiértékeléshez bioinformatikai szoftverek segítségével, mint pl. KEGG, UniProt, GeneSpring, Cytoscape, Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) and Geneontology (GO). Továbbá alap programozási ismeretek bevezetésére is lehetőség nyílhat.
Elvárások:
angol nyelvtudás; Excel használata; minimum heti egy nap TDK munka, ami otthonról is végezhető;”
A témára eddig lehet jelentkezni:
2023-10-01