A Kontrolling Igazgatóság a Gazdasági Főigazgatóság egységeként, a Semmelweis Egyetem adatainak információ sűrítésével, a megalapozott vezetői döntésekhez szükséges információk előállításával foglalkozik.
Az Igazgatóság felelős a különféle gazdasági jellegű vezetői tervek, éves vezetői költségvetési terv elkészítéséért, a tervek teljesülésének nyomon követéséért, a keretgazdálkodás feltételeinek megteremtéséért és ellenőrzéséért.
A Kontrolling Igazgatóság szervezeti ügyrendje a Minőségirányítási Osztály honlapján olvasható (csak az egyetem belső hálózatából érhető el).
Osztályai: