Das Institut für Organische Chemie wurde vom Gesundheitsminister am 13. März 1957 gegründet. Erster Institutsvorstand war ab 27. Dezember 1957 Professor Ottó Clauder, dem zwischen 1977 und 1996 Professor László Szabó folgte. Zwischen 1996 und 1997 war Dr. Ákos Kocsis der ernannte Direktor. Seit 1997 bis 2016 leitete Professor Péter Mátyus das Institut. Danach wurde Dr. Gábor Krajsovszky als ernannter Vorstand bis Juni 2017 aufgetragen. Seit Juli 2017 ist der Direktor Dr. István Mándity.