In vivo vizsgálatok során kapott rekonstrukciók automatikus korregisztrációja 3D atlaszokkal
Leírás:
Az elmúlt években a kisállatokon végzett in vivo képalkotás jelentős fejlődésen esett át. A multimodális képalkotás során eltérő fizikai elven működő képalkotó eszközök (PET, SPECT, CT, MRI, OCT) segítségével az élő szervezetekben zajló molekuláris folyamatokat nanoliteres felbontással vizsgálhatjuk – pontos anatómiai lokalizációval. A pontos orvosi diagnózis felállításához az élettani folyamatok térbeli és időbeli leírása szükséges, meghatározva a szervekben, szövetekben található anyagok koncentrációját és ezek változását. A kísérletek során kapott nagy mennyiségű képi információ feldolgozása jelenleg nagyrészt szakmailag képzett személyzet segítségével zajlik. Ennek oka, hogy bár léteznek olyan 3D atlaszok amelyekben a szervek találhatók, de az in vivo rekonstrukciók és az atlaszok korregisztációja nem megoldott. A teljesen automatikus kiértékeléshez szükséges jól működő algoritmusok jelenleg jórészt hiányoznak. A munka témája egy olyan eljárás kidolgozása, amely az anatómiai atlaszok és az eltérő modalitások során nyert rekonstrukciók korregisztrációjával segíti a fenti algoritmusok fejlesztését. A munka során a hallgató megismeri az eltérő modalitások segítségével nyert képek fizikai és biológiai információtartalmát, az atlaszok típusait, az eddig létező korregisztrációs eljárásokat. A hallgató feladata egy sikeresen alkalmazott algoritmus olyan módon történő átalakítása, hogy az megfelelően működjön a leggyakrabban használt modalitások és atlaszok egyesítésére.
Elvárások:
Interdiszciplináris megközelítés, programozási ismeretek, orvosi képalkotási ismeretek vagy érdeklődés a téma iránt.