A Pathologie folyóirat 2024. novemberi számában jelent meg egy tanulmány, amelynek szerzői között volt az Egészségbiztonság Nemzeti Laboratórium Adatvezérelt Egészség Divízió szakértője, dr. Pollner Péter és a divízió vezetője, dr. Szócska Miklós is.
A kutatás célja egy olyan módszer kifejlesztése volt, amely lehetővé teszi a csontbiopsziás minták háromdimenziós rekonstruálását a meglévő 2D szövettani metszetek alapján. A vizsgálat során a csontbiopsziás mintákat dekalcinálták (eltávolították belőlük a kalciumot), majd paraffinba ágyazták. Ezt követően 5 mikrométer vastag metszeteket készítettek a mintákból, amelyeket hematoxilin-eozinnal festettek meg és digitálisan beszkennelték őket.
A képek elemzésére egy módosított U-Net neurális hálózatot alkalmaztak a szövettani struktúrák kategorizálására, majd LoFTR alapú jellemzőillesztést és affinitás-transzformációkat használtak a 3D rekonstrukció elkészítéséhez. A mikromorfológiai paramétereket mind hisztológiai (szövettani), mind mikro-CT adatokból elemezték.
Az új módszer kiváló, 95,26%-os pontosságot ért el, és az F-mutatója 0,9320 volt, ami nagyfokú megbízhatóságot jelez. A kutatás eredményei alapján ez az új módszer lehetővé teszi a szöveti mikroarchitektúra részletes, háromdimenziós vizsgálatát, még a mikro-CT-nél is nagyobb felbontással, miközben megőrzi a sejtszerkezeti információkat.
Az angol nyelvű publikáció teljes terjedelmében itt érhető el: Reconstructing 3D histological structures using machine learning (artificial intelligence) algorithms
A kutatás az Egészségbiztonság Nemzeti Laboratórium (RRF-2.3.1-21-2022-00006) és az NKFIH támogatásával jött létre.