Konzorcij AmReSu sastoji se od međunarodno priznatih istraživačkih centara izvrsnosti LMM, UAntwerp i IdISBa. Neupitna znanstvena izvrsnost ovih ustanova u području istraživanja imuniteta i infekcija, međunarodna mreža suradnika, tehnički kapaciteti te inicijative usmjerene ka poticanju inovacija svrstavaju ih u najbolje twinning partnere za SU i BFM:
LMM, UAntwerp ima veliko iskustvo u medicinskim mikrobiološkim istraživanjima i međunarodno je priznata ustanova zbog svog multidisciplinarnog translacijskog pristupa proučavanju bakterijskih uzročnika. S jedne strane, uvelike smo uključeni u koordinaciju mreža za praćenje i prikupljanje podataka o globalnoj uporabi antibiotika i rezistenciji bakterija, a s druge strane u korištenju najsuvremenijih molekularnih tehnika za proučavanje evolucije i dinamike prijenosa rezistentnih patogena pod pritiskom primjene antibiotika kako u pacijenata, tako i u bolnicama i u zajednici. Također smo uspostavili laboratorijsku mrežu na nivou Europe (LAB-Net) kroz koju LMM educira i održava visokokvalitetnu, geografski pokrivenu europsku laboratoriju mrežu za praćenje COMBACTE za podršku razvoja antibakterijskih lijekova. Razvoj dijagnostike za brzo otkrivanje zaraznih bolesti jedan je od naših ključnih istraživačkih programa. Naša nedavno uspostavljena istraživačka mreža koja se bavi proučavanjem klinički relevantnih biofilmova koristeći oba modela laboratorijskih sustava, kao i meta (genomski/transkriptomski) pristupi pokazali su se vrlo uspješnima i prema ishodima istraživanja i privlačenju suradnika iz područja industrije. LMM ima veliko iskustvo u koordiniranju i upravljanju velikim znanstvenim konzorcijima. UAntwerp ima impresivno iskustvo u sudjelovanju na međunarodnim projektima, od kojih je nekoliko financiralo Europsko istraživačko vijeće (ERC), dvadeset osam suradničkih projekata i jednom Marie Curie istraživanju odobrenom kroz FP7/H2020 program te više od 800 radova objavljenih u recenziranim časopisima. Belgijska vlada je nedavno dodijelila prof. Surbhi Malhotra-Kumar priznanje za izvrsnost u radu METHUSALEM-VAX-IDEA (2019.-2025.).
IdISBa (HUSE) Odjel za mikrobiologiju broji više od 200 recenziranih publikacija, od kojih je većina objavljena u 25/10 najboljih časopisa, što odražava izvrsnu znanstvenu aktivnost. Također, u posljednjih 5 godina, Odjel za mikrobiologiju IdISBa (HUSE) pribavio je značajna nacionalna i međunarodna sredstva za financiranje 6 nacionalnih kompetitivnih projekata i 6 zajedničkih međunarodnih projekata (SAD, Australija, Europa). Osim toga, Odjel je dobio značajna nacionalna sredstva za ljudske resurse, kao i sredstva za farmaceutsku industriju (MSD; Gilead). LMM, UAntwerp i IdISBa bit će od temeljne važnosti za osiguranje uspješnog znanstvenog i inovativnog razvoja SU-a, kroz zajednički angažman svjetski priznatih voditelja istraživačkih skupina i istraživačkih skupina SU-a, slijedeći znanstvenu strategiju navedenu u odjeljku 1.3.4. usredotočenu na tri znanstvena smjera i podijeljenu u nekoliko radnih skupina prema ekspertizi i zajedničkim znanstvenim interesima istraživačkih skupina iz partnerskih institucija. Ova se strategija oslanja na podizanje istraživačkog profila postojećeg osoblja, kao i samih SU-a i BFM-a. Nadalje, odnos između twinning institucija bit će ojačan bliskom suradnjom unutar twinning grupa, čime će se pridonijeti daljnjem proširenju prijašnje uspješne suradnje. Nakon zajedničkog brainstorminga, identificirane su i dogovorene određene sinergije između istraživačkih partnerskih organizacija.
Semmelweis Sveučilište (SU) – Koordinator
Sveučilište Semmelweis (SU) javna je, neprofitna obrazovna i istraživačka ustanova. U Mađarskoj i srednjoeuropskoj regiji, Sveučilište Semmelweis jedna je od vodećih institucija, s izvanrednim akademskim međunarodnim položajem. Sveučilište Semmelweis, dosegnuo je prestižnu poziciju 102 mjesta, kao jedina mađarska ustanova na listi 200 najboljih međunarodnih sveučilišta u svijetu. Popis koji je objavio Times Higher Education temelji se na rezultatima pokazatelja “međunarodni izgledi”, koji uzima u obzir omjer međunarodnih i domaćih studenata i osoblja te međunarodnu suradnju.
Što se tiče istraživačkih postignuća i ranga izdavačke djelatnosti, Sveučilište Semmelweis vodeće je sveučilište na području medicine u Mađarskoj i ima kumulativni faktor utjecaja veći od 2000 godišnje. Budući da Sveučilište Semmelweis ima mnogo uspostavljene suradnje u zemlji, jedan od najznačajnijih primjera istraživačke suradnje je s Mađarskom akademijom znanosti, pa Erasmus+ otvara vrata cijeloj istraživačkoj zajednici u Mađarskoj.
Korijeni sveučilišta datiraju iz davne 1769. godine, te je sveučilište, više od 240 godina poslije, jedno od najpoznatijih mađarskih sveučilišta sa 6 fakulteta te 1400 profesora i istraživača. Na temelju indeksa istraživanja i razvoja jedno je od najboljih sveučilišta u zemlji sa 22 R&D grupe koje se bave istraživanjem i razvojem, te više od 100 aktivnih istraživačkih timova koji objavljuju u međunarodno priznatim i visoko rangiranim časopisima. Na 25 sveučilišnih klinika prakticira se i medicina i obrazovanje na visokoj razini. Sveučilište je od svog osnutka izdalo više od 100.000 titula, a trenutno obrazuje 12.000 studenata. Znanstveni život karakterizira broj od 1.500 publikacija godišnje, 1.400 čimbenika utjecaja na godinu i 35 – 40 doktorskih disertacija na godinu. Sveučilište se ponosi sa svoja tri dobitnika Nobelove nagrade, koja je uručena mađarskim liječnicima koji su studirali na ovom sveučilištu..
Medicinski fakultet Sveučilišta Semmelweis osnovan je 1769. godine, najstariji je i najveći fakultet Sveučilišta Semmelweis. Fakultet pruža obrazovne standarde koji su u potpunosti u skladu s onima drugih visokokvalitetnih europskih medicinskih fakulteta. Program studija medicine (koji rezultira stupnjem doktora znanosti) dostupan je na tri jezika: mađarskom, engleskom i njemačkom. Osim obrazovnih aktivnosti, Fakultet se zalaže za pružanje najviše razine zdravstvene zaštite i provođenje naprednih znanstvenih istraživanja kako u svojim učionicama tako i na kliničkim odjelima.
Glavni odjel SU -a koji sudjeluje u ovom prijedlogu projekta je Institut za medicinsku mikrobiologiju. Glavna područja našeg interesa su epidemiološka i molekularno -biološka istraživanja Enterobacteriaceae.
University of Antwerp (UA), LMM – Partner
LMM, UAntwerp ima veliko iskustvo u medicinskim mikrobiološkim istraživanjima i međunarodno je priznata ustanova zbog svog multidisciplinarnog translacijskog pristupa proučavanju bakterijskih uzročnika. S jedne strane, uvelike smo uključeni u koordinaciju mreža za praćenje i prikupljanje podataka o globalnoj uporabi antibiotika i rezistenciji bakterija, a s druge strane u korištenju najsuvremenijih molekularnih tehnika za proučavanje evolucije i dinamike prijenosa rezistentnih patogena pod pritiskom primjene antibiotika kako u pacijenata, tako i u bolnicama i u zajednici. Također smo uspostavili laboratorijsku mrežu na nivou Europe (LAB-Net) kroz koju LMM educira i održava visokokvalitetnu, geografski pokrivenu europsku laboratoriju mrežu za praćenje COMBACTE za podršku razvoja antibakterijskih lijekova. Razvoj dijagnostike za brzo otkrivanje zaraznih bolesti jedan je od naših ključnih istraživačkih programa. Naša nedavno uspostavljena istraživačka mreža koja se bavi proučavanjem klinički relevantnih biofilmova koristeći oba modela laboratorijskih sustava, kao i meta (genomski/transkriptomski) pristupi pokazali su se vrlo uspješnima i prema ishodima istraživanja i privlačenju suradnika iz područja industrije. LMM ima veliko iskustvo u koordiniranju i upravljanju velikim znanstvenim konzorcijima. UAntwerp ima impresivno iskustvo u sudjelovanju na međunarodnim projektima, od kojih je nekoliko financiralo Europsko istraživačko vijeće (ERC), dvadeset osam suradničkih projekata i jednom Marie Curie istraživanju odobrenom kroz FP7/H2020 program te više od 800 radova objavljenih u recenziranim časopisima LMM je priznat kao istraživački centar izvrsnosti VAX-IDEA VAX-IDEA | Vaccine and Infectious Diseases Excellence in Antwerp | University of Antwerp (uantwerpen.be).
Laboratorij za medicinsku mikrobiologiju (LMM) ima svjetski ugled, a vode ga prof. Dr. Herman Goossens i prof. Dr. Surbhi Malhotra-Kumar. LMM je osnovan 1995. godine i razvio je opsežnu ekspertizu u molekularnoj dijagnostici, upotrebi antibiotika i rezistenciji, te istraživanjima u bolnici i primarnoj zdravstvenoj zaštiti. Uključeni smo i funkcioniramo kao središnji mikrobiološki laboratorij u brojnim međunarodnim projektima, pružajući usluge iznimne znanstvene kvalitete. LMM je koordinator nekoliko europskih projekata, poput European Surveillance for Antimicrobial Consumption (ESAC), Genomics to Combat Resistance against Antibiotics in Community-acquired LRTI in Europe (GRACE), Translational Research on Antimicrobial resistance and Community-acquired infections in Europe (TRACE), Platform for European Preparedness Against (Re-) emerging Epidemics (PREPARE), and New Diagnostics for Infectious Diseases (ND4ID). LMM je također središnji koordinacijski laboratorij za LAB-Net, laboratorijsku mrežu u okviru COMBACTE-Net-a (Combatting Bacterial Resistance in Europe), koji se sastoji od nekoliko stotina dijagnostičkih mikrobioloških laboratorija u više od 40 europskih zemalja, te mnogih specijaliziranih istraživačkih mikrobioloških laboratorija. Istraživanje utjecaja uporabe antibiotika na humane patogene i komenzalnu floru ljudi i životinja jedno je od glavnih fokusa istraživanja LMM -a. Trenutno koristimo najsuvremenije genetske, genomske i mikrobiomske pristupe za proučavanje utjecaja antibiotika te su nam odobrena sredstva za postavljanje tehnologije sekvenciranja dugih sljedova. Izvodimo sekvenciranja nove generacije (next-generation sequencing, NGS) za vlastita istraživanja, ali također imamo sklopljeno nekoliko ugovora s predstavnicima industrije za izvođenje i analizu podataka NGS-a. Naši drugi glavni pravac istraživanja usmjeren je na biofilmove jer se sve veći broj kritičnih infekcija i njihova perzistencija povezuju sa stvaranjem biofilma na biomaterijalima. Istražujemo mikrobnu interakciju u biofilmu, kako in vitro tako i in vivo, u infekcijama povezanim s uređajima, poput pneumonije povezane s mehaničkom ventilacijom i infekcija povezanih s kateterom, a također koristimo NGS tehnike za razumijevanje mikrobnih konzorcija povezanih s biofilmom, poput onih uočenih u pneumoniji povezanoj s mehaničkom ventilacijom i upali srednjeg uha. Nadalje, proučavamo mehanizme rezistencije na antibiotike kod patogenih bakterija. Glavni fokus je na istraživanju ‘starih’ antibiotika koji su ponovno uvedeni u kliničku praksu i čiji mehanizmi rezistencije još nisu poznati, poput kolistina, nitrofurantoina i fosfomicina. I klinički i in vitro pasažirani sojevi podvrgavaju se sekvenciranju cijelog genoma, studijama stabilnosti rezistencije i procjeni troškova kako bi se razumjela pojava mehanizama rezistencije, kao i njihova sudbina u zajednici. Drugi glavni fokus LMM -a je poboljšanje mikrobiološke dijagnoze zaraznih bolesti kroz razvoj, evaluaciju, validaciju i optimizaciju dijagnostičkih testova. LMM je odgovoran za uspostavljanje, obuku i održavanje visokokvalitetne geografski reprezentativne europske mreže dijagnostičkih mikrobioloških laboratorija za podršku kliničkim ispitivanjima koja se bave razvojem antibakterijskih lijekova. LMM također koordinira globalnu mrežu bolnica za proučavanje propisivanja antimikrobnih lijekova. Ovi podaci služe za poboljšanje kvalitete propisivanja antibiotika, osobito u zemljama s niskom i srednjom razinom prihoda. Konačno, LMM koordinira inicijative kliničkih istraživanja kako bi se uspostavila brza reakcija na prijeteće pandemije ili nove emergentne epidemije u Europi, kroz novi dizajn ispitivanja kao što su ispitivanja na prilagodljivoj platformi.
Son Espases University Hospital-IdISBa – Partner
Institut za istraživanje zdravlja Balearskih otoka (IdISBa) sastoji se od Regionalnog ministarstva zdravstva Vlade Balearskih otoka, Zdravstvene službe Balearskih otoka (IB-Salut) i Sveučilišta Balearskih otoka (UIB). IdISBa je akreditirana od strane Nacionalnog zdravstvenog instituta Carlos III koji pripada španjolskom Ministarstvu znanosti, inovacija i sveučilišta.
Sjedište IdISBa-e nalazi se u aneksu zgrade Sveučilišne bolnice Son Espases (HUSE), te uključuje više od 4.000 m2 objekata za istraživanje i poučavanje iz prostora HUSE-a. HUSE je javna bolnica koja se nalazi u Palma de Mallorci i pripada strukturi IB-Salut, primarna je zdravstvena služba Mallorce i referentna bolnica na Balearskim otocima. Opslužuje 1.047.288 stanovnika, od čega je 320.215 dodijeljenih. Opremljena je radnom snagom od 4.833 radnika, a njeni stručnjaci godišnje obave oko 504.800 ambulantnih konzultacija, 127.300 hitnih slučajeva i 19.000 kirurških intervencija. Medicinski fakultet Balearskih otoka smješten je također u HUSE -u.
IdISBa je javna ustanova koja upravlja zdravstvenim međunarodnim i nacionalnim projektima na Balearskim otocima, odgovorna je za istraživačke aktivnosti na Balearskim otocima i usmjerena na 7 znanstvenih područja koja uključuju 53 istraživačke skupine s više od 550 istraživača. Unutar IdISBa-e, Odjel za mikrobiologiju ima svoju vlastitu skupinu, nazvanu “Grupa za istraživanje antimikrobne rezistencije i patogeneze bakterijskih infekcija”, koja je vodeća istraživačka skupina u znanstvenom području zaraznih i imunoloških bolesti.
Klinika Za Infektivne Bolesti „Dr. Fran Mihaljevic” (BFM) – Partner
Klinika za infektivne bolesti (BFM) vodeća je ustanova za dijagnostiku i liječenje zaraznih bolesti u Hrvatskoj i susjednoj regiji. U ovoj tercijarnoj zdravstvenoj ustanovi godišnje se liječi preko 7000 hospitaliziranih bolesnika te 65.000 ambulantnih bolesnika. Klinika pruža zadravstvene usluge za područje od cca. 1 milijun stanovnika (stanovništvo grada Zagreba i Zagrebačke županije), ali i za sve bolesnike iz drugih regija Hrvatske i susjednih zemalja koji su upućeni u bolnicu.
BFM je nastavna baza Medicinskog fakulteta i Stomatološkog fakulteta Sveučilišta u Zagrebu te je nastavna bolnica za studente preddiplomskih i poslijediplomskih studija medicine, dentalne medicine i sestrinstva te liječnika na specijalizaciji iz drugih medicinskih područja – kliničke mikrobiologije, epidemiologije, interne medicine, neurologije, pedijatrije, itd.
Kao vodeća ustanova za zarazne bolesti u Republici Hrvatskoj, osnovana 1893.god., BFM služi i kao nacionalni referentni centar za sljedeća područja: dijagnostiku i liječenje zaraznih bolesti, virusnog hepatitisa, HIV-infekcije, infekcije mokraćnog sustava, praćenje rezistencije bakterija na antibiotike, tropsku medicinu i medicinu putnika te izvantjelesnu membransku oksigenaciju akutno-respiratorno ugroženih bolesnika.
BFM također aktivno surađuje sa sljedećim stručnim društvima Hrvatskog liječničkog zbora: Hrvatsko društvo za infektivne bolesti, Hrvatsko društvo za kliničku mikrobiologiju, Hrvatsko društvo za urogenitalne i spolno prenosive infekcije, Hrvatsko društvo za kemoterapiju, Hrvatsko društvo za biosigurnost i biozaštitu, Hrvatsko društvo za putničku, tropsku i migracijsku medicinu.
Klinika je sudjelovala u mnogim istraživačkim projektima i kliničkim ispitivanjima koja provode liječnici iz bolnice u suradnji s međunarodnim partnerima. Posebna područja interesa za istraživanja su infekcije u imunokompromitiranih, racionalna uporaba antibiotika i kemoterapeutika, nove dijagnostičke metode za brzu etiološku dijagnozu, kontrola bolničkih infekcija, itd.
Trenutno su u tijeku međunarodni projekti i suradnja koja uključuje istraživanja u području molekularne dijagnostike, vektorskog koncepta cjepiva protiv citomegalovirusa, imunologije virusa i cjepiva, spremnosti na (novo) nastupajuće epidemije, itd.