Dr. Galamb Orsolya és dr. Sípos Ferenc PhD hallgatók a laboratóriumban A Semmelweis Egyetem II. Belklinika Sejtanalitikai Laboratóriumában (www.bel2.sore.hu/cellanal) idén év elején egy Közép-Európában eddig még nem alkalmazott molekuláris biológiai technológia került bevezetésre. Ismertetésére dr. Molnár Béla tudományos főmunkatársat kértük meg. - A teljes genom, nagydenzitású chiptechnológia alapja egy olyan nagysűrűségű cDNS array alkalmazása, amelyen az eddig ismert összes mRNS transcript molekula (36 000) párhuzamos vizsgálata válik lehetővé. A rendszer másik kulcsfontosságú eleme a nagyfelbontású scanner, amely képes a chiplapka felszínén létrejövő reakciók észlelésére. A technológia stabilitását az együtt szállított hibridizáló és chip mosó állomások még csak fokozzák. A technológia azonban nemcsak mRNS expressziós profilok vizsgálatára alkalmas, hanem egy teljesen új eljárás alapján DNS szekvenciák meghatározására is. Ma 30 000 bázisbár egyidejű szekvencia meghatározására van lehetőség. A DNS-szekvenáló chip egyik fontos ismérve, hogy a keresni kívánt szekvenciákat a felhasználó kérésére speciálisan rögzíti a microcarray felszínén. A DNS-szekvenáló chip DNS információja a felhasználó speciális génkombinációját vizsgálja. Ilyen szintű molekuláris biológiai információmennyiség kezelése természetesen nem lehetséges megfelelő informatikai háttér nélkül. Ezért a technológia szerves része az a bioinformatikai programcsomag, amely egyrészről az adatok biztonságos rögzítését, elérhetőségét biztosítja, másrészről támogatja a speciális biológiai, orvosi értelmezését a kapott, eddigi módszereinkhez képes nagyságrendekkel több adatnak. Ezen belül külön hangsúlyt kapnak az úgynevezett virtuális sejtmodell programok, amelyek sejtbiológiai ismereteinket tartalmazva képesek a chipinformációk sejtanalitikai elemzésére. Így az egyes génelváltozások nem egyedül, nem kiragadva a környezetükből, hanem teljes metabolikus vagy szignál transzdukciós összefüggésben értelmezhetők. - Hogyan jutottak ehhez a berendezéshez? - A technológiát közbeszerzéses pályázat után az Affymetrix cég szállította és installálta a Semmelweis Egyetem II. Belklinika Sejtanalitikai Laborjába. A technológia beszerzésére az NKFP pályázat keretében került sor, amelynek célja az urémiás betegek prognosztikai faktorainak vizsgálataira alkalmas DNS chip kifejlesztése. Ez a pályázat az I. Gyermekklinika vezetésével indult, tagja a II. Belklinika mellett a III. Belklinika is. Ipari partnerként az Izinta Kft., az Adver Kft. és a Roche Magyarország vesz részt. Egy ilyen szintű pályázat azonban természetesen igényli a fejlett molekuláris biológiai módszerek elérhetőségét, alkalmazását is. A Sejtanalitikai Laboratórium, amely több mint 400 négyzetméteren, 10 légkondicionált, modern helyiségben található, rendelkezik szövettani metszetekből akár egyes sejtek szelektív kinyerésére alkalmas lézer microdissectorral, mágneses sejtszeparátorral, sejtkomponensek izolálására és ampflikilására alkalmas technikákkal. A molekuláris biológia terén real-time PCR, protein chip technikákkal. A hagyományos immunhisztokémiai vizsgálatok elvégzéséhez szükséges módszerek elérhetőségén kívül digitális kép rögzítésére alkalmas automata fluoeszcens és fénymikroszkópos rendszerekkel. - Milyen a berendezés hozzáférhetősége? - A Semmelweis Egyetem Genomikai Hálózat tagjaként a technológiák elérhetők az egyetem többi intézménye számára is. A Klinikai Doktori Iskola alaplaboratóriumaként a labor részt vesz a PhD hallgatók kutatási programjainak aktív megvalósításában. Jelenleg 5 nappali tagozatos, 2 levelező és 1 egyéni képzésben résztvevő hallgató munkáját segíti. A labor működését több forrásból finanszírozza. A költségek fedezésére az OTKA műszerpályázatok mellett a Széchenyi pályázatok, illetve újabban egyes vizsgálatok OEP finanszírozása ad lehetőséget. - Csak egyetemi témákkal foglalkoznak? - A géntechnológiai centrum nemcsak a kutatásban, a diagnosztikában, hanem az oktatásban, a technológiai transzferben is aktív szerepet játszik egyetemi és országos szinten. A laboratórium által szervezett sejtanalitikai konferenciák - melyek a Magyar Biofizikai Társaság, a Patológiai Társaság, a Gasztroenterológiai Társaság háttértámogatásával zajlanak - az ország egész területéről, az orvosi, biológiai, agrártudományi centrumokból vonzanak 300 embert kétévente. Ezek a rendezvények - délelőtt elméleti előadások, délben poszterszekciók, délután gyakorlati bemutatók kiscsoportos rotációs rendszerben - lehetőséget adnak a legmodernebb technológiák elméletének és gyakorlatának a bemutatására. A konferenciák szervezésében a Sejtanalitikai Laboratórium mellett az I. Patológiai Intézet is részt vesz. Ebben az évben is érdekes aktuális programot tudunk ajánlani, főtémaként a chiptechnológia alkalmazási lehetőségeivel. Közreadta: -KE- 2003. évi Magyar Innovációs Nagydíjat nyert a dr. Molnár Béla vezette 3DHISTECH Kft. által kifejlesztett digitális szövettani laboratórium. A díj átadására március 30-án került sor a Parlamentben. A 37 benyújtott pályázat közül nyolcat díjaztak. (a szerk.)

 

Lap teteje | Semmelweis Egyetem újság | 2004/5. szám | Előző cikk | Következő cikk