Általános Orvostudományi Kar intézetei
Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet Biokémiai Tanszék
Farmakológiai és Farmakoterápiás Intézet
Genetikai-, Sejt- és Immunbiológiai Intézet
Genomikai Medicina és Ritka Betegségek Intézete
Igazságügyi- és Biztosítás-orvostani Intézet
Klinikai Kísérleti Kutató Intézet
Kórélettani Intézet
Laboratóriumi Medicina Intézet
Orvosi Vegytani, Molekuláris Biológiai és Patobiokémiai Intézet
Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet
Patológiai, Igazságügyi és Biztosítási Orvostani Intézet
Reumatológiai és Klinikai Immunológiai Tanszék
Anatómiai, Szövet- és Fejlődéstani Intézet
Biofizikai és Sugárbiológiai Intézet
Szaknyelvi Intézet
Transzlációs Medicina Központ
Általános Orvostudományi Kar klinikái
2nd Department of Pediatrics Clinic
Aneszteziológiai és Intenzív Terápiás Klinika
Belgyógyászati és Hematológiai Klinika
II. Sz. Belgyógyászati Klinika
II. Sz. Belgyógyászati Klinika Geriátriai Tanszéki Csoport
Belgyógyászati és Hematológiai Klinika Infektológiai Tanszéki Csoport
Belgyógyászati és Onkológiai Klinika
Bőr-, Nemikórtani és Bőronkológiai Klinika
Fül-Orr-Gégészeti és Fej-Nyaksebészeti Klinika
Gyermekgyógyászati Klinika
Gyermekgyógyászati Klinika Tűzoltó utcai részleg
Endokrinológia Tanszék
Heart and Vascular Center – Cardiology Department
Intervenciós Radiológiai Tanszék
Klinik für Pneumologie
Népegészségtani Intézet
Nukleáris Medicina Tanszék
Onkológiai Központ
Pszichiátriai és Pszichoterápiás Klinika
Radiológiai Klinika
Sebészeti, Transzplantációs és Gasztroenterológiai Klinika
Szülészeti és Nőgyógyászati Klinika
Traumatológiai Tanszék
Városmajori Szív-és Érgyógyászati Klinika Érsebészeti és Endovaszkuláris Tanszék
Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinika Kardiológiai Tanszéki Csoport
Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinika Repülő-és Űrorvostani Tanszék
Városmajori Szív- és Érgyógyászati Klinika Szívsebészeti Tanszéki Csoport
Semmelweis Heart and Vascular Centre Department of Cardiology
Városmajori Szív-és Érgyógyászati Klinika-Pancreas Betegségek Kiválósági Központ
Fogorvostudományi Kar klinikái és tanszékei
Arc-Állcsont-Szájsebészeti és Fogászati Klinika
Fogászati és Szájsebészeti Oktató Intézet
Gyermekfogászati és Fogszabályozási Klinika
Helyreállító Fogászati és Endodonciai Klinika
Konzerváló Fogászati Klinika
Orális Diagnosztikai Tanszék
Parodontológiai Klinika
Orálbiológiai Tanszék
Gyógyszerésztudományi Kar intézetei
Egyetemi Gyógyszertár Gyógyszerügyi Szervezési Intézet
Egészségügyi Közszolgálati Kar
Kutatásmenedzsment Munkacsoport
Külső intézetek
Infektológiai Tanszéki Csoport DPC-OHII Szent László Kórház
Magyar Honvédség Egészségügyi Központ, Tudományos Kutató és Laboratóriumi Intézet, Katonai Mikrobiológiai és Környezet-egészségügyi Osztály, Járványügyi Virológiai Laboratórium