{"id":14922,"date":"2022-11-28T10:13:40","date_gmt":"2022-11-28T09:13:40","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/?p=14922"},"modified":"2022-11-28T10:41:29","modified_gmt":"2022-11-28T09:41:29","slug":"transzlacios-tudorakkutatas","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/2022\/11\/28\/transzlacios-tudorakkutatas\/","title":{"rendered":"Transzl\u00e1ci\u00f3s T\u00fcd\u0151r\u00e1kkutat\u00e1s"},"content":{"rendered":"<p><strong>Projektr\u0151l<\/strong> <br \/>\nA <strong>daganat ellenes gy\u00f3gyszerfejleszt\u00e9sek<\/strong> manaps\u00e1g a vil\u00e1g egyik vezet\u0151 piaci ter\u00fclet\u00e9t k\u00e9pezik. Orvos-biol\u00f3giai vonatkoz\u00e1s\u00fa bioinformatikai kutat\u00e1sok ter\u00fclet\u00e9n nemzetk\u00f6zi, valamint a <strong>Nemzeti Kutat\u00e1si Fejleszt\u00e9si \u00e9s Innov\u00e1ci\u00f3s Hivatal<\/strong> kutat\u00e1si p\u00e1ly\u00e1zataival (OTKA #124652 \u00e9s OTKA #129664) t\u00e1mogatott tudom\u00e1nyos csoportunk \u00f6t \u00e9ve foglalkozik ezen a ter\u00fcleten kutat\u00e1sokkal. Munk\u00e1nk sor\u00e1n <strong>\u00faj ter\u00e1pi\u00e1s c\u00e9lpontokat, valamint predikt\u00edv \u00e9s prognosztikus faktorokat keres\u00fcnk daganatos betegs\u00e9gekben<\/strong>; eredm\u00e9nyeinket \u00e9vente t\u00f6bb alkalommal niv\u00f3s, nemzetk\u00f6zi foly\u00f3iratokban publik\u00e1ljuk, ez\u00e1ltal ezen a ter\u00fcleten az egyik kiemelked\u0151 munkacsoportt\u00e1 n\u0151tt\u00fck ki magunkat. <br \/>\nAz adataink exponenci\u00e1lis n\u00f6vekednek, kutat\u00e1si eredm\u00e9nyeink k\u00e9t\u00e9vente megdupl\u00e1z\u00f3dnak! Eredm\u00e9nyeket \u00f6sszetett <strong>adatelemz\u00e9si, adatvizualiz\u00e1ci\u00f3s, Big Data \u00e9s AI (machine learning) megold\u00e1sokkal<\/strong> elemezz\u00fck, melyek tov\u00e1bb er\u0151s\u00edtik poz\u00edci\u00f3nkat nemzetk\u00f6zi vonatkoz\u00e1sban is. Ezekhez a feladatokhoz keress\u00fcnk TDK hallgat\u00f3t.<\/p>\n<p>\n<strong>Kutat\u00e1s \u00f6sszefoglal\u00f3ja, c\u00e9lkit\u0171z\u00e9sei<\/strong><br \/>\nA <strong>daganatos betegs\u00e9gekben a korai felismer\u00e9shez<\/strong> hat\u00e9kony, a szervezetet nem k\u00e1ros\u00edt\u00f3 m\u00f3dszer nem \u00e1ll rendelkez\u00e9sre. Annak ellen\u00e9re, hogy napjainkra a ter\u00e1pi\u00e1s lehet\u0151s\u00e9gek sz\u00e9les reperto\u00e1rja \u00e1ll m\u00e1r rendelkez\u00e9s\u00fcnkre (kemo- radio- targeted- \u00e9s immunter\u00e1pi\u00e1k \u00e9s kombin\u00e1ci\u00f3ik), a betegek ter\u00e1pi\u00e1s v\u00e1lasza nagyfok\u00fa heterogenit\u00e1st, mutat, melyek h\u00e1tter\u00e9r\u0151l sok esetben nem ismert tudom\u00e1nyos adat. Az elm\u00falt id\u0151ben a kutat\u00f3k \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9st tal\u00e1ltak sz\u00e1mos (daganatos) betegs\u00e9g \u00e9s a szervezetben el\u0151fordul\u00f3 bakt\u00e9riumok \u00e9s m\u00e1s molekul\u00e1k k\u00f6z\u00f6tt. Egyik c\u00e9lunk a <strong>daganatos betegek sz\u00e9klet\u00e9nek, v\u00e9r\u00e9nek, vizelet\u00e9nek mikrobi\u00e1lis<\/strong> profiljainak (taxon\u00f3mia \u00e9s metabolitok) m\u00e9lyrehat\u00f3 vizsg\u00e1lata valamint a betegek v\u00e9r\u00e9ben kering\u0151 daganatos sejtek DNS \u00e9s RNS mint\u00e1zat\u00e1nak felder\u00edt\u00e9se, melyet a \u201efoly\u00e9kony biopszia (liquid biopsy)\u201d mintav\u00e9telek elterjed\u00e9se miatt egyre sz\u00e9lesebb k\u00f6rben alkalmaznak tumoros betegek diagnosztik\u00e1j\u00e1ban \u00e9s monitoroz\u00e1s\u00e1ban. Az \u00edgy keletkezett nagy mennyis\u00e9g\u0171 adatot szeretn\u00e9nk \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9sbe hozni t\u00fcd\u0151r\u00e1kos betegek klinikai param\u00e9tereivel, illetve ter\u00e1pi\u00e1s v\u00e1lasz\u00e1val, bele\u00e9rtve azok mell\u00e9khat\u00e1sprofilj\u00e1t \u00e9s sikeress\u00e9g\u00e9t.<br \/>\nA kutat\u00e1s analitikai r\u00e9sze kieg\u00e9sz\u00fcl betegek tumormint\u00e1inak molekul\u00e1ris sz\u00f6vettani vizsg\u00e1lat\u00e1val, mely sor\u00e1n immuncitok\u00e9mia (IHC) \u00e9s RNAscope\u00a9 technik\u00e1kkal potenci\u00e1lis biomarkerek in situ azonos\u00edt\u00e1sa t\u00f6rt\u00e9nik meg. A marker molekul\u00e1k expresszi\u00f3s mint\u00e1zat\u00e1t kvalitat\u00edv (fluoreszcens kett\u0151s fest\u00e9sek, IHC-RNAscope multiplexing) \u00e9s kvantitat\u00edv m\u00f3dszerek (manu\u00e1lis \u00e9s szoftveres automatiz\u00e1lt scoring \u00e9s morfometria) seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel elemezz\u00fck ki \u00e9s hozzuk \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9sbe a betegek klinikai param\u00e9tereivel, bele\u00e9rtve a teljes \u00e9s progresszi\u00f3s-mentes t\u00fal\u00e9l\u00e9s\u00fcket (OS \u00e9s PFS).<br \/>\nAz \u00edgy nyert adatok \u00e9s \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9sek seg\u00edthetnek a betegs\u00e9g sz\u0171r\u00e9s\u00e9ben, korai diagn\u00f3zis\u00e1ban, valamint az alkalmazott kezel\u00e9s hat\u00e9konys\u00e1g\u00e1nak n\u00f6vel\u00e9s\u00e9ben, tov\u00e1bb\u00e1 mell\u00e9khat\u00e1sainak cs\u00f6kkent\u00e9s\u00e9ben. Eredm\u00e9nyeink hozz\u00e1j\u00e1ruln\u00e1nak a daganatos betegek \u00e9letmin\u0151s\u00e9g\u00e9nek javul\u00e1s\u00e1hoz, \u00e9s hat\u00e1ssal lehetnek t\u00fal\u00e9l\u00e9sre is. Tov\u00e1bb\u00e1 a biomarkerek vizsg\u00e1lata lehet\u0151s\u00e9get nyithat gy\u00f3gyszeres c\u00e9lpontok azonos\u00edt\u00e1s\u00e1ra.<\/p>\n<p style=\"text-align: center\"><strong>TDK-hallgat\u00f3knak <\/strong><\/p>\n<p><strong>Munkav\u00e9gz\u00e9s helye \u00e9s ideje<\/strong><br \/>\nT\u00f6r\u00f6kb\u00e1lint T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet alkalmank\u00e9nt<br \/>\nAnat\u00f3miai, Sz\u00f6vet \u00e9s Fejl\u0151d\u00e9stani Int\u00e9zet, Semmelweis Egyetem heti 1 nap<\/p>\n<p>\n<strong>Feladatok<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0T\u00f6bb ezer beteg klinikai adat\u00e1t lek\u00e9rdezni az informatikai rendszerb\u0151l, feldolgozni kutat\u00e1si szempontok \u00e9s az irodalom alapj\u00e1n. Lek\u00e9rdez\u00e9sek, adatb\u00e1zis \u00e9p\u00edt\u00e9s \u00e9s kezel\u00e9s<\/li>\n<li>\u00a0Nagymennyis\u00e9g\u0171 klinikai \u00e9s biomarker adat feldolgoz\u00e1sa, statisztikai sz\u00e1m\u00edt\u00e1sok<\/li>\n<li>\u00a0\u00d6sszef\u00fcgg\u00e9sek keres\u00e9se az adathalmazb\u00f3l; az adatok rendszerez\u00e9se \u00e9s szintetiz\u00e1l\u00e1sa<\/li>\n<li>\u00a0Adatvizualiz\u00e1ci\u00f3<\/li>\n<li>\u00a0Rutin sz\u00f6vettani technik\u00e1k hum\u00e1n \u00e9s kis\u00e9rletes eg\u00e9r sz\u00f6veteken: szervek izol\u00e1ci\u00f3ja, fix\u00e1l\u00e1sa, be\u00e1gyaz\u00e1sa, metsz\u00e9se, immunfest\u00e9se. Mikroszk\u00f3pos k\u00e9panal\u00edzis.<\/li>\n<li>\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzis, morfometria, immunfest\u00e9sek kvantitat\u00edv elemz\u00e9s\u00e9hez \u201escoring\u201d technik\u00e1k fejleszt\u00e9se \u00e9s haszn\u00e1lata<\/li>\n<\/ul>\n<p>\n<strong>Csapat<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0A csapat 7 f\u0151s, mely v\u00e1rhat\u00f3an k\u00e9t postdoc, k\u00e9t PhD-hallgat\u00f3t, k\u00e9t TDK hallgat\u00f3t \u00e9s egy laborat\u00f3riumi szakasszisztenst fog jelenteni. A csapat tagjai egym\u00e1ssal \u00e9s a T\u00f6r\u00f6kb\u00e1linti T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet orvosaival, \u00e1pol\u00f3ival fognak kommunik\u00e1lni, egyeztetni. A feladatok els\u0151sorban a k\u00e9t kutat\u00e1svezet\u0151t\u0151l \u00e9rkeznek, illetve az eredm\u00e9nyek bemutat\u00e1sa, riport\u00e1l\u00e1s is fel\u00e9j\u00fck t\u00f6rt\u00e9nik<\/li>\n<li>\u00a0Megbesz\u00e9l\u00e9sek heti 1\u00d745 perc online. Havonta egyszer v\u00e1rhat\u00f3an szem\u00e9lyesen hosszabban<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Elv\u00e1r\u00e1sok<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0Folyamatban l\u00e9v\u0151 egyetemi tanulm\u00e1nyok: orvosin teljes\u00edtett 3 \u00e9v, m\u00e1shol BSc diploma, vagy BSc utols\u00f3 f\u00e9l\u00e9ve (orvos, biol\u00f3gus, bioinformatikus, m\u00e9rn\u00f6k-informatikus, eg\u00e9szs\u00e9g\u00fcgyi mern\u00f6k, molekul\u00e1ris bionika, programoz\u00f3 matematikus, biom\u00e9rn\u00f6k)<\/li>\n<li>\u00a0Foly\u00e9kony angol nyelvtud\u00e1s sz\u00f3ban \u00e9s \u00edr\u00e1sban (eredm\u00e9nyek r\u00e9szletes kidolgoz\u00e1sa, \u00e9rtelmez\u00e9se angol nyelven)<\/li>\n<li>\u00a0Adatb\u00e1zisok haszn\u00e1lat\u00e1ban, kezel\u00e9s\u00e9ben szerzett alapszint\u0171 tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0Magasszint\u0171 \u00f6n\u00e1ll\u00f3s\u00e1g, proaktivit\u00e1s, szakmai k\u00edv\u00e1ncsis\u00e1g<br \/>\nEl\u0151ny\u00f6k<\/li>\n<li>\u00a0Rutin sz\u00f6vettani technik\u00e1ban szerzett alapszint\u0171 tapasztalat (metsz\u00e9s, rutin sz\u00f6vettani fest\u00e9s)<\/li>\n<li>\u00a0Immunhisztok\u00e9mi\u00e1ban \u00e9s mikroszk\u00f3pi\u00e1ban szerzett tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0SQL \u00e9s legal\u00e1bb egy scriptnyelv alapszint\u0171 ismerete (R vagy Python)<\/li>\n<li>\u00a0Matematikai, statisztikai eszk\u00f6z\u00f6k \u00e9s m\u00f3dszertanok ismerete<\/li>\n<li>\u00a0Genomikai\/Transzkriptomikai\/Proteomikai adatok elemz\u00e9s\u00e9ben szerzett tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzisben, m\u00e9r\u00e9sekben \u00e9s szerkeszt\u00e9sben szerzett tapasztalat (ImageJ, Adobe Photoshop\/Illustrator)<\/li>\n<\/ul>\n<p>\n<strong>Kompenz\u00e1ci\u00f3<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0Lehet\u0151s\u00e9g a k\u00e9s\u0151bbiekben PhD k\u00e9pz\u00e9sbe val\u00f3 becsatlakoz\u00e1sra<\/li>\n<li>\u00a0Lehet\u0151s\u00e9g TDK konferenci\u00e1n val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9telre, rektori p\u00e1lyamunka, szakdolgozat \u00edr\u00e1s\u00e1ra<\/li>\n<li>\u00a0Niv\u00f3s tudom\u00e1nyos k\u00f6zlem\u00e9nyekben szerz\u0151s\u00e9g<\/li>\n<li>\u00a0Sz\u00f6vettani \u00e9s RNS\/Protein in situ detekt\u00e1l\u00e1s\u00e1ra \u00e9p\u00fcl\u0151 technik\u00e1k (IHC, RNAscope, Multiplexing) elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1sa<\/li>\n<li>\u00a0Magasszint\u0171 adatelemz\u00e9si \u00e9s vizualiz\u00e1ci\u00f3s technik\u00e1k elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1s\u00e1nak lehet\u0151s\u00e9ge<\/li>\n<li>\u00a0Szabadon v\u00e1lasztott tr\u00e9ningek, nemzetk\u00f6zi konferenci\u00e1kon val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel<\/li>\n<li>\u00a0Betekint\u00e9si lehet\u0151s\u00e9g nemzetk\u00f6zi szinten is orvosbiol\u00f3giai \u00e9s gy\u00f3gyszert\u00e1mad\u00e1spontok fejleszt\u00e9s\u00e9be<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: center\"><strong>PhD-hallgat\u00f3knak<\/strong><\/p>\n<p>\n<strong>Munkav\u00e9gz\u00e9s helye \u00e9s ideje<\/strong><br \/>\nT\u00f6r\u00f6kb\u00e1lint T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet heti 20 \u00f3ra<br \/>\nAnat\u00f3miai, Sz\u00f6vet \u00e9s Fejl\u0151d\u00e9stani Int\u00e9zet, Semmelweis Egyetem alkalmank\u00e9nt<\/p>\n<p>\n<strong>Feladatok<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>T\u00f6bb ezer beteg klinikai adat\u00e1t lek\u00e9rdezni az informatikai rendszerb\u0151l, feldolgozni kutat\u00e1si szempontok \u00e9s<br \/>\naz irodalom alapj\u00e1n. Lek\u00e9rdez\u00e9sek, adatb\u00e1zis \u00e9p\u00edt\u00e9s \u00e9s kezel\u00e9s<\/li>\n<li>\u00a0Nagymennyis\u00e9g\u0171 klinikai \u00e9s biomarker adat feldolgoz\u00e1sa, statisztikai sz\u00e1m\u00edt\u00e1sok<\/li>\n<li>\u00a0\u00d6sszef\u00fcgg\u00e9sek keres\u00e9se az adathalmazb\u00f3l; az adatok rendszerez\u00e9se \u00e9s szintetiz\u00e1l\u00e1sa<\/li>\n<li>\u00a0Adatvizualiz\u00e1ci\u00f3<\/li>\n<li>\u00a0Rutin sz\u00f6vettani technik\u00e1k hum\u00e1n \u00e9s kis\u00e9rletes eg\u00e9r sz\u00f6veteken: szervek izol\u00e1ci\u00f3ja, fix\u00e1l\u00e1sa, be\u00e1gyaz\u00e1sa,<br \/>\nmetsz\u00e9se, immunfest\u00e9se. Mikroszk\u00f3pos k\u00e9panal\u00edzis<\/li>\n<li>\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzis, morfometria, immunfest\u00e9sek kvantitat\u00edv elemz\u00e9s\u00e9hez \u201escoring\u201d technik\u00e1k<br \/>\nfejleszt\u00e9se \u00e9s haszn\u00e1lata<\/li>\n<li>\u00a0Javaslatt\u00e9tel arra vonatkoz\u00f3an, hogy MIT kell m\u00e9rni, \u00e9s MIT lehet az adatokb\u00f3l kinyerni<\/li>\n<li>\u00a0P\u00e1ly\u00e1zatok, tudom\u00e1nyos publik\u00e1ci\u00f3k \u00edr\u00e1s\u00e1ban val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel a vezet\u0151 kutat\u00f3kkal<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Csapat<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0A csapat 7 f\u0151s, mely v\u00e1rhat\u00f3an k\u00e9t postdoc, k\u00e9t PhD-hallgat\u00f3t, k\u00e9t TDK hallgat\u00f3t \u00e9s egy laborat\u00f3riumi<br \/>\nszakasszisztenst fog jelenteni. A csapat tagjai egym\u00e1ssal \u00e9s a T\u00f6r\u00f6kb\u00e1linti T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet orvosaival,<br \/>\n\u00e1pol\u00f3ival fognak kommunik\u00e1lni, egyeztetni. A feladatok els\u0151sorban a k\u00e9t kutat\u00e1svezet\u0151t\u0151l \u00e9rkeznek,<br \/>\nilletve az eredm\u00e9nyek bemutat\u00e1sa, riport\u00e1l\u00e1s is fel\u00e9j\u00fck t\u00f6rt\u00e9nik<\/li>\n<li>Megbesz\u00e9l\u00e9sek heti 1\u00d745 perc online. Havonta egyszer v\u00e1rhat\u00f3an szem\u00e9lyesen hosszabban<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Elv\u00e1r\u00e1sok<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0MSc diploma a ter\u00fcleten (orvos, biol\u00f3gus, bioinformatikus, m\u00e9rn\u00f6k-informatikus, eg\u00e9szs\u00e9g\u00fcgyi mern\u00f6k,<br \/>\nmolekul\u00e1ris bionika, programoz\u00f3 matematikus, biom\u00e9rn\u00f6k)<\/li>\n<li>\u00a0Foly\u00e9kony angol nyelvtud\u00e1s sz\u00f3ban \u00e9s \u00edr\u00e1sban (eredm\u00e9nyek r\u00e9szletes kidolgoz\u00e1sa, \u00e9rtelmez\u00e9se angol<br \/>\nnyelven)<\/li>\n<li>\u00a0Alapvet\u0151 ismeretek adatb\u00e1zisok haszn\u00e1lat\u00e1ban, kezel\u00e9s\u00e9ben<\/li>\n<li>\u00a0Matematikai, statisztikai eszk\u00f6z\u00f6k \u00e9s m\u00f3dszertanok ismerete<\/li>\n<li>\u00a0Magasszint\u0171 \u00f6n\u00e1ll\u00f3s\u00e1g, proaktivit\u00e1s, szakmai k\u00edv\u00e1ncsis\u00e1g<\/li>\n<\/ul>\n<p>\n<strong>El\u0151ny\u00f6k<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00a0Metagenomikai (mikrobi\u00e1lis) adatok (DNS, RNS, feh\u00e9rj\u00e9k, k\u00e9miai vegy\u00fcletek megl\u00e9v\u0151 adatb\u00e1zisokb\u00f3l)<br \/>\nelemz\u00e9s\u00e9ben szerzett tapasztalat (MetaPhlan, Humann, Megan)<\/li>\n<li>\u00a0Genomikai\/Transzkriptomikai\/Proteomikai adatok elemz\u00e9s\u00e9ben szerzett tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0SQL \u00e9s legal\u00e1bb egy scriptnyelv alapszint\u0171 ismerete (R vagy Python)<br \/>\n\u00a0Adatvizualiz\u00e1ci\u00f3s tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0Rutin sz\u00f6vettani technik\u00e1ban szerzett alapszint\u0171 tapasztalat (metsz\u00e9s, rutin sz\u00f6vettani fest\u00e9s)<\/li>\n<li>\u00a0Immunhisztok\u00e9mi\u00e1ban \u00e9s mikroszk\u00f3pi\u00e1ban szerzett tapasztalat<\/li>\n<li>\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzisben, m\u00e9r\u00e9sekben \u00e9s szerkeszt\u00e9sben szerzett tapasztalat (ImageJ, Adobe<br \/>\nPhotoshop\/Illustrator)<\/li>\n<\/ul>\n<p><strong>Kompenz\u00e1ci\u00f3<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li>\u00d6szt\u00f6nd\u00edjas PhD poz\u00edci\u00f3 \u00e9s lehet\u0151s\u00e9g PhD fokozat szerz\u00e9s\u00e9re<\/li>\n<li>F\u00e9l\u00e9v munka ut\u00e1n lehet\u0151s\u00e9g PhD \u00f6szt\u00f6nd\u00edj melletti b\u00e9rkieg\u00e9sz\u00edt\u00e9sre<\/li>\n<li>Niv\u00f3s tudom\u00e1nyos k\u00f6zlem\u00e9nyekben szerz\u0151s\u00e9g (D1-Q1)<\/li>\n<li>Sz\u00f6vettani \u00e9s RNS\/Protein in situ detekt\u00e1l\u00e1s\u00e1ra \u00e9p\u00fcl\u0151 technik\u00e1k (IHC, RNAscope, Multiplexing) elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1sa<\/li>\n<li>Magasszint\u0171 adatelemz\u00e9si \u00e9s vizualiz\u00e1ci\u00f3s technik\u00e1k elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1s\u00e1nak lehet\u0151s\u00e9ge<\/li>\n<li>Szabadon v\u00e1lasztott tr\u00e9ningek, nemzetk\u00f6zi konferenci\u00e1kon val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel<\/li>\n<li>Betekint\u00e9si lehet\u0151s\u00e9g nemzetk\u00f6zi szinten is orvosbiol\u00f3giai \u00e9s gy\u00f3gyszert\u00e1mad\u00e1spontok fejleszt\u00e9s\u00e9be<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: center\"><strong>Postdoc kutat\u00f3knak <\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Munkav\u00e9gz\u00e9s helye<br \/>\n<\/strong>T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet T\u00f6r\u00f6kb\u00e1lint, teljes munkaid\u0151, heti 40 \u00f3ra<br \/>\nAnat\u00f3miai, Sz\u00f6vet \u00e9s Fejl\u0151d\u00e9stani Int\u00e9zet, Semmelweis Egyetem, alkalmank\u00e9nt<\/p>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Feladatok<\/strong><\/p>\n<ul style=\"list-style-type: square\">\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Nagymennyis\u00e9g\u0171 adatb\u00f3l val\u00f3s korrel\u00e1ci\u00f3k, mint\u00e1k megtal\u00e1l\u00e1sa adatb\u00e1ny\u00e1szati m\u00f3dszerrel. Ny\u00edlt hozz\u00e1f\u00e9r\u00e9s\u0171 klinikai \u00e9s genetikai\/transzkriptomikai\/proteomikai adatb\u00e1zisokhoz val\u00f3 hozz\u00e1f\u00e9r\u00e9s, adatleh\u00edv\u00e1s \u00e9s kezel\u00e9s (TCGA, Oncomine, NCBI, stb\u2026)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0T\u00f6bb ezer beteg klinikai adat\u00e1t lek\u00e9rdezni az informatikai rendszerb\u0151l, feldolgozni kutat\u00e1si szempontok \u00e9s az irodalom alapj\u00e1n. Lek\u00e9rdez\u00e9sek, adatb\u00e1zis \u00e9p\u00edt\u00e9s \u00e9s kezel\u00e9s<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Oszt\u00e1lyos orvosokkal, \u00e1pol\u00f3kkal val\u00f3 val\u00f3 kommunik\u00e1ci\u00f3 \u00e9s koordin\u00e1ci\u00f3 \u00e9s PhD-hallgat\u00f3k \u00e9s az asszisztens ir\u00e1ny\u00edt\u00e1sa a betegmint\u00e1k gy\u0171jt\u00e9se, t\u00e1rol\u00e1sa \u00e9s feldolgoz\u00e1sa kapcs\u00e1n.<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Nagymennyis\u00e9g\u0171 klinikai \u00e9s biomarker adat feldolgoz\u00e1sa, statisztikai sz\u00e1m\u00edt\u00e1sok<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0\u00d6sszef\u00fcgg\u00e9sek keres\u00e9se az adathalmazb\u00f3l; az adatok rendszerez\u00e9se \u00e9s szintetiz\u00e1l\u00e1sa<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Adatvizualiz\u00e1ci\u00f3<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Algoritmusok fejleszt\u00e9se \u00e9s hat\u00e9konys\u00e1guk ellen\u0151rz\u00e9se, \u201eproof of concept\u201d hetente update<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzis, morfometria, immunfest\u00e9sek kvantitat\u00edv elemz\u00e9s\u00e9hez \u201escoring\u201d technik\u00e1k fejleszt\u00e9se \u00e9s haszn\u00e1lata<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Javaslatt\u00e9tel arra vonatkoz\u00f3an, hogy MIT kell m\u00e9rni, \u00e9s MIT lehet az adatokb\u00f3l kinyerni<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0P\u00e1ly\u00e1zatok, tudom\u00e1nyos publik\u00e1ci\u00f3k \u00edr\u00e1s\u00e1ban val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel a vezet\u0151 kutat\u00f3kkal<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: left\">\n<strong>Csapat<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0A csapat 7 f\u0151s, mely v\u00e1rhat\u00f3an k\u00e9t postdoc, k\u00e9t PhD-hallgat\u00f3t, k\u00e9t TDK hallgat\u00f3t \u00e9s egy laborat\u00f3riumi szakasszisztenst fog jelenteni. A csapat tagjai egym\u00e1ssal \u00e9s a T\u00f6r\u00f6kb\u00e1linti T\u00fcd\u0151gy\u00f3gyint\u00e9zet orvosaival, \u00e1pol\u00f3ival fognak kommunik\u00e1lni, egyeztetni. A feladatok els\u0151sorban a k\u00e9t kutat\u00e1svezet\u0151t\u0151l \u00e9rkeznek, illetve az eredm\u00e9nyek bemutat\u00e1sa, riport\u00e1l\u00e1s is fel\u00e9j\u00fck t\u00f6rt\u00e9nik<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Megbesz\u00e9l\u00e9sek online hetente 2&#215;45 perc id\u0151tartamban. Havonta egyszer v\u00e1rhat\u00f3an szem\u00e9lyesen hosszabban<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Elv\u00e1r\u00e1sok<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0MSc \u00e9s PhD-fokozat a ter\u00fcleten (orvos, biol\u00f3gus, bioinformatikus, m\u00e9rn\u00f6k-informatikus, eg\u00e9szs\u00e9g\u00fcgyi mern\u00f6k, molekul\u00e1ris bionika, programoz\u00f3 matematikus, biom\u00e9rn\u00f6k)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Foly\u00e9kony angol nyelvtud\u00e1s sz\u00f3ban \u00e9s \u00edr\u00e1sban (eredm\u00e9nyek r\u00e9szletes kidolgoz\u00e1sa, \u00e9rtelmez\u00e9se angol nyelven)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Genomikai\/Transzkriptomikai\/Proteomikai adatok elemz\u00e9s\u00e9ben szerzett gyakorlat<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0SQL \u00e9s legal\u00e1bb egy scriptnyelv emelt szint\u0171 ismerete (R vagy Python)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Adatvizualiz\u00e1ci\u00f3s tapasztalat<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Adatb\u00e1zisok haszn\u00e1lat\u00e1ban szerzett gyakorlat<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Matematikai, statisztikai eszk\u00f6z\u00f6k, algoritmusok, illetve adatb\u00e1ny\u00e1sz eszk\u00f6z\u00f6k \u00e9s m\u00f3dszertanok ismerete<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Magasszint\u0171 \u00f6n\u00e1ll\u00f3s\u00e1g, proaktivit\u00e1s, szakmai k\u00edv\u00e1ncsis\u00e1g<\/li>\n<\/ul>\n<p style=\"text-align: left\">\n<strong>El\u0151ny\u00f6k<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Metagenomikai (mikrobi\u00e1lis) adatok (DNS, RNS, feh\u00e9rj\u00e9k, k\u00e9miai vegy\u00fcletek megl\u00e9v\u0151 adatb\u00e1zisokb\u00f3l) elemz\u00e9s\u00e9ben szerzett tapasztalat (MetaPhlan, Humann, Megan)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Szoftveres k\u00e9panal\u00edzisben, m\u00e9r\u00e9sekben \u00e9s szerkeszt\u00e9sben szerzett tapasztalat (ImageJ, Adobe Photoshop\/Illustrator)<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Ny\u00edlt hozz\u00e1f\u00e9r\u00e9s\u0171 klinikai \u00e9s genetikai\/transzkriptomikai\/proteomikai adatb\u00e1zisokhoz val\u00f3 hozz\u00e1f\u00e9r\u00e9s, adatleh\u00edv\u00e1s \u00e9s kezel\u00e9s (TCGA, Oncomine, NCBI, stb\u2026)<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Kompenz\u00e1ci\u00f3<\/strong><\/p>\n<ul>\n<li style=\"text-align: left\"><span style=\"font-size: 1rem\">\u00a0Megegyez\u00e9s szerint<\/span><\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Niv\u00f3s tudom\u00e1nyos k\u00f6zlem\u00e9nyekben szerz\u0151s\u00e9g<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Szabadon v\u00e1lasztott tr\u00e9ningek, nemzetk\u00f6zi konferenci\u00e1kon val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Szakmai fejl\u0151d\u00e9s lehet\u0151s\u00e9ge, mely meg\u00e1gyazhat a k\u00e9s\u0151bbiekben a jel\u00f6lt tudom\u00e1nyos karrierj\u00e9nek, vezet\u0151 kutat\u00f3k\u00e9nt<\/li>\n<li style=\"text-align: left\">\u00a0Betekint\u00e9si lehet\u0151s\u00e9g nemzetk\u00f6zi szinten is orvosbiol\u00f3giai \u00e9s gy\u00f3gyszert\u00e1mad\u00e1spontok fejleszt\u00e9s\u00e9be<\/li>\n<\/ul>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Referenci\u00e1k:<\/strong><br \/>\n<a href=\"https:\/\/scholar.google.com\/citations?user=d2Kh52oAAAAJ&amp;hl=en\">https:\/\/scholar.google.com\/citations?user=d2Kh52oAAAAJ&amp;hl=en<\/a><br \/>\n<a href=\"https:\/\/scholar.google.com\/citations?hl=en&amp;user=CbC9oxIAAAAJ\">https:\/\/scholar.google.com\/citations?hl=en&amp;user=CbC9oxIAAAAJ <\/a><\/p>\n<p style=\"text-align: left\"><strong>Kontakt:<\/strong><\/p>\n<p style=\"text-align: left\">Dr. Lohinai Zolt\u00e1n PhD,<br \/>\nPulmonol\u00f3gia,<br \/>\nonkol\u00f3gia szakorvos, kutat\u00e1svezet\u0151 <br \/>\n<a href=\"mailto:zoltan.lohinai@koranyi.hu\">zoltan.lohinai@koranyi.hu<\/a>; +36 30 437 8992<\/p>\n<p>&nbsp;<\/p>\n<p style=\"text-align: left\">Dr. D\u00f3ra D\u00e1vid PhD, <br \/>\negyetemi adjunktus, kutat\u00e1svezet\u0151 <br \/>\n<a href=\"mailto:dora.david@med.semmelweis-univ.hu\">dora.david@med.semmelweis-univ.hu<\/a> +36 30 375 0652<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Projektr\u0151l A daganat ellenes gy\u00f3gyszerfejleszt\u00e9sek manaps\u00e1g a vil\u00e1g egyik vezet\u0151 piaci ter\u00fclet\u00e9t k\u00e9pezik. Orvos-biol\u00f3giai vonatkoz\u00e1s\u00fa bioinformatikai kutat\u00e1sok ter\u00fclet\u00e9n nemzetk\u00f6zi, valamint a Nemzeti Kutat\u00e1si Fejleszt\u00e9si \u00e9s Innov\u00e1ci\u00f3s Hivatal kutat\u00e1si p\u00e1ly\u00e1zataival (OTKA #124652 \u00e9s OTKA #129664) t\u00e1mogatott tudom\u00e1nyos csoportunk \u00f6t \u00e9ve foglalkozik ezen a ter\u00fcleten kutat\u00e1sokkal. Munk\u00e1nk sor\u00e1n \u00faj ter\u00e1pi\u00e1s c\u00e9lpontokat, valamint predikt\u00edv \u00e9s prognosztikus faktorokat keres\u00fcnk &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":101719,"featured_media":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-14922","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-allasajanlatok"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14922","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/users\/101719"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=14922"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14922\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":14929,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/14922\/revisions\/14929"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=14922"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=14922"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/phd\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=14922"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}