{"id":19932,"date":"2013-06-24T07:37:49","date_gmt":"2013-06-24T06:37:49","guid":{"rendered":"http:\/\/semmelweis-egyetem.hu\/hirek\/?p=19932"},"modified":"2013-06-25T11:06:23","modified_gmt":"2013-06-25T10:06:23","slug":"biobank-a-varosmajori-sziv-es-ergyogyaszati-klinikan","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/2013\/06\/24\/biobank-a-varosmajori-sziv-es-ergyogyaszati-klinikan\/","title":{"rendered":"Biobank a V\u00e1rosmajori Sz\u00edv- \u00e9s \u00c9rgy\u00f3gy\u00e1szati Klinik\u00e1n"},"content":{"rendered":"

\"biobank_bemutato\"<\/a>Biobanknak nevezz\u00fck az orvosi, tudom\u00e1nyos, kutat\u00e1si c\u00e9l\u00fa biol\u00f3giai mintagy\u0171jtem\u00e9nyeket. T\u00e1gabb \u00e9rtelemben v\u00e9ve egy olyan adatb\u00e1zis-rendszer, amely egyr\u00e9szt tartalmazza a biol\u00f3giai mint\u00e1k pontos hely\u00e9t, m\u00e1sr\u00e9szt a mint\u00e1khoz k\u00f6t\u0151d\u0151 egy\u00e9b adatok sz\u00e9les k\u00f6r\u00e9t. A V\u00e1rosmajorban zajl\u00f3 vizsg\u00e1latokhoz egy saj\u00e1t, web-alap\u00fa, b\u00f6ng\u00e9sz\u0151b\u0151l el\u00e9rhet\u0151 rendszer ker\u00fclt kialak\u00edt\u00e1sra, mely biztos\u00edtja t\u00f6bb felhaszn\u00e1l\u00f3 egyidej\u0171 munk\u00e1j\u00e1t \u00e9s az adatok nagyfok\u00fa biztons\u00e1g\u00e1t.<\/p>\n

A biobankot kezdetben a Budakal\u00e1sz Epidemiol\u00f3giai Vizsg\u00e1lat lebonyol\u00edt\u00e1s\u00e1hoz kezdt\u00fck el kialak\u00edtani. Ez egy \u00f6nk\u00e9ntes alap\u00fa, primer prevenci\u00f3s cardiovascularis sz\u0171r\u0151program. A megc\u00e9lzott popul\u00e1ci\u00f3 mintegy 8000 f\u0151. A vizsg\u00e1lat sor\u00e1n egy\u00e9nenk\u00e9nt t\u00f6bb mint 500 param\u00e9ter ker\u00fcl regisztr\u00e1l\u00e1sra. Ez olyan mennyis\u00e9g\u0171 adatot jelent, amely igen nagy kapacit\u00e1s\u00fa adatb\u00e1zist ig\u00e9nyel. Jelenleg t\u00f6bb mint 2100 p\u00e1ciens adatai tal\u00e1lhat\u00f3ak meg a rendszerben. A V\u00e1rosmajori Sz\u00edv- \u00e9s \u00c9rgy\u00f3gy\u00e1szati Klinik\u00e1n p\u00e1rhuzamosan fut\u00f3 t\u00f6bb kutat\u00e1si projekt \u00e9s regiszter (Sz\u00edvtranszplant\u00e1ci\u00f3s biobank, Sportol\u00f3i regiszter, sz\u00edv-CT vizsg\u00e1latok) \u00e9p\u00edt\u00e9se sor\u00e1n ugyanez a saj\u00e1t fejleszt\u00e9s\u0171 biobank l\u00e1tja el ezeket a feladatokat.<\/p>\n

Az egyes adatb\u00e1zisokban szerepl\u0151 betegek vagy kontrollok szem\u00e9lyes adatai k\u00f3dolva, titkos\u00edtva ker\u00fclnek elt\u00e1rol\u00e1sra, az adatokhoz csak megfelel\u0151 jogosults\u00e1g birtok\u00e1ban lehet hozz\u00e1f\u00e9rni. Az elt\u00e9r\u0151 vizsg\u00e1latok elt\u00e9r\u0151 t\u00edpus\u00fa adatok r\u00f6gz\u00edt\u00e9s\u00e9t teszik sz\u00fcks\u00e9gess\u00e9. A keretrendszer haszn\u00e1lat\u00e1val k\u00fcl\u00f6n\u00f6sebb informatikai tud\u00e1s n\u00e9lk\u00fcl a vizsg\u00e1latokhoz \u0171rlapokat, azokhoz pedig k\u00e9rd\u00e9seket lehet rendelni. A k\u00e9rd\u00e9sek sz\u00e1m, sz\u00f6veg, egyszeres vagy t\u00f6bbsz\u00f6r\u00f6s v\u00e1laszt\u00e1sos, illetve d\u00e1tum jelleg\u0171ek lehetnek. Ha bizonyos k\u00e9rd\u00e9sekre csak megadott felt\u00e9telek eset\u00e9n szeretn\u00e9nk v\u00e1laszt r\u00f6gz\u00edteni, lehet\u0151s\u00e9g ny\u00edlik a k\u00e9rd\u00e9sek k\u00f6z\u00f6tt \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9seket kialak\u00edtani. Egyszer\u0171 p\u00e9ld\u00e1ja ennek a doh\u00e1nyz\u00e1s, mely eset\u00e9ben gyakoris\u00e1got csak akkor van \u00e9rtelme r\u00f6gz\u00edteni, amennyiben az adott szem\u00e9ly doh\u00e1nyzik. Ez a m\u00f3dszerrel a relev\u00e1ns adatok gyorsabban ker\u00fclhetnek r\u00f6gz\u00edt\u00e9sre.<\/p>\n

\"dashboard\"<\/a>A nyers adatokb\u00f3l gyakran sz\u00e1rmaztatott mennyis\u00e9geket k\u00e9sz\u00edt\u00fcnk, amit m\u00e1r a biobank rendszerben el lehet v\u00e9gezni. Egyszer\u0171 p\u00e9ld\u00e1ja ennek a BMI kisz\u00e1m\u00edt\u00e1sa, de enn\u00e9l sokkal bonyolultabb sz\u00e1m\u00edt\u00e1sokat is v\u00e9geztethet\u00fcnk, ak\u00e1r k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 score-ok meg\u00e1llap\u00edt\u00e1s\u00e1ra is lehet\u0151s\u00e9g van.<\/p>\n

A gy\u00f3gyszerszed\u00e9si szok\u00e1sok r\u00f6gz\u00edt\u00e9se sor\u00e1n biobankunk k\u00e9pes arra, hogy a gy\u00f3gyszer nev\u00e9nek felvitelekor automatikusan \u00f6sszekapcsolja azt a gy\u00f3gyszert\u00f6rzsi inform\u00e1ci\u00f3kkal, \u00edgy a hat\u00f3anyag, annak mennyis\u00e9ge, \u00e9s az ATC k\u00f3d is r\u00f6gz\u00edt\u00e9sre ker\u00fcl. \u00cdgy ha arra vagyunk k\u00edv\u00e1ncsiak, hogy h\u00e1nyan szednek statint, akkor el\u00e9g, ha az ennek megfelel\u0151 ATC-re sz\u0171r\u00fcnk r\u00e1 az adatb\u00e1zisban.<\/p>\n

Az \u00f6sszes adat r\u00e9szben vagy eg\u00e9szben is export\u00e1lhat\u00f3, melynek eredm\u00e9nye egy excel f\u00e1jl, mely bet\u00f6lthet\u0151 a statisztikai programokba. Emellett lehet\u0151s\u00e9g van k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 riportok k\u00e9sz\u00edt\u00e9s\u00e9re is, \u00edgy \u00f6sszefoglal\u00f3 v\u00e9lem\u00e9ny, lelet gener\u00e1lhat\u00f3, de ak\u00e1r n\u00e9vre sz\u00f3l\u00f3 beleegyez\u0151 nyilatkozatot, t\u00e1j\u00e9koztat\u00f3kat is lehet \u00edgy k\u00e9sz\u00edteni PDF form\u00e1tumban.<\/p>\n

Az elt\u00e1rolt mint\u00e1k poz\u00edci\u00f3ja r\u00f6gz\u00edt\u00e9sre ker\u00fcl az adatb\u00e1zisban, term\u00e9szetesen h\u0171t\u0151k, rack-ek, dobozok pontos sz\u00e1m\u00e1t, hely\u00e9t minden projekthez k\u00fcl\u00f6n lehet defini\u00e1lni. A program k\u00e9pes egyedi QR (vonal) k\u00f3ddal \u00e9s sz\u00f6veges c\u00edmk\u00e9kkel is ell\u00e1tni a mint\u00e1kat, \u00edgy el\u0151seg\u00edtve a biztons\u00e1gos minta-kezel\u00e9st. A megfelel\u0151 szem\u00e9lyek kiv\u00e1laszt\u00e1sa ut\u00e1n egy lista k\u00e9sz\u00edthet\u0151 a sz\u00fcks\u00e9ges mint\u00e1k poz\u00edci\u00f3j\u00e1r\u00f3l, \u00edgy minimaliz\u00e1lva a m\u00e9lyh\u0171t\u0151k nyitva tart\u00e1s\u00e1hoz sz\u00fcks\u00e9ges id\u0151t.<\/p>\n

A biobankban val\u00f3 adatt\u00e1rol\u00e1s rugalmass\u00e1ga folyt\u00e1n az adatok \u00e9s mint\u00e1k hat\u00e9konyabb t\u00e1rol\u00e1s\u00e1t teszi lehet\u0151v\u00e9 \u00fagy, hogy k\u00f6zben minimaliz\u00e1lja az adatbeviteli hib\u00e1k sz\u00e1m\u00e1t. Mindezek mellett az adatok biztons\u00e1g\u00e1r\u00f3l rendszeres adatment\u00e9s gondoskodik, illetve minden v\u00e1ltoztat\u00e1s napl\u00f3z\u00e1sra ker\u00fcl, teh\u00e1t b\u00e1rmikor ut\u00f3lag vissza lehet keresni, hogy ki, mikor \u00e9s pontosan mit v\u00e1ltoztatott az adatokon. A biobankr\u00f3l tov\u00e1bbi r\u00e9szleteket a www.biobankok.hu\/bemutato<\/a> oldalon olvashatnak.<\/p>\n

\u00cdrta a V\u00e1rosmajori Biobank munkacsoport nev\u00e9ben: dr. Bagyura Zsolt, dr. Kiss Loretta \u00e9s Prof. Merkely B\u00e9la
\nA V\u00e1rosmajori Biobank fejleszt\u00e9se r\u00e9szben a T\u00c1MOP-4.2.1.B-09\/1\/KMR-2010-0001 p\u00e1ly\u00e1zat t\u00e1mogat\u00e1s\u00e1val t\u00f6rt\u00e9nt.<\/p>\n

Etikai deklar\u00e1ci\u00f3
\nA beteg vagy hozz\u00e1tartoz\u00f3j\u00e1nak megfelel\u0151 t\u00e1j\u00e9koztat\u00e1s\u00e1t k\u00f6vet\u0151en a vizsg\u00e1latba t\u00f6rt\u00e9n\u0151 beleegyez\u0151 nyilatkozat mellett a v\u00e9r mintav\u00e9telhez a genetikai adatok kezel\u00e9se c\u00e9lj\u00e1b\u00f3l az XXI\/2008 E\u00fcM t\u00f6rv\u00e9ny \u00e1ltal el\u0151\u00edrtaknak megfelel\u0151en k\u00fcl\u00f6n nyilatkozat al\u00e1\u00edr\u00e1s\u00e1ra ker\u00fcl sor.\"T\u00c1MOP<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

<\/a> Biobanknak nevezz\u00fck az orvosi, tudom\u00e1nyos, kutat\u00e1si c\u00e9l\u00fa biol\u00f3giai mintagy\u0171jtem\u00e9nyeket. T\u00e1gabb \u00e9rtelemben v\u00e9ve egy olyan adatb\u00e1zis-rendszer, amely egyr\u00e9szt tartalmazza a biol\u00f3giai mint\u00e1k pontos hely\u00e9t, m\u00e1sr\u00e9szt a mint\u00e1khoz k\u00f6t\u0151d\u0151 egy\u00e9b adatok sz\u00e9les k\u00f6r\u00e9t. A V\u00e1rosmajorban zajl\u00f3 vizsg\u00e1latokhoz egy saj\u00e1t, web-alap\u00fa, b\u00f6ng\u00e9sz\u0151b\u0151l el\u00e9rhet\u0151 rendszer ker\u00fclt kialak\u00edt\u00e1sra, mely biztos\u00edtja t\u00f6bb felhaszn\u00e1l\u00f3 egyidej\u0171 munk\u00e1j\u00e1t \u00e9s az adatok nagyfok\u00fa biztons\u00e1g\u00e1t. A …<\/p>\n","protected":false},"author":11,"featured_media":19934,"comment_status":"closed","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[161,168],"tags":[188],"class_list":["post-19932","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-tudomany","category-kiemelt","tag-tudomanyos-hirek-rendezvenyek"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19932","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/users\/11"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=19932"}],"version-history":[{"count":6,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19932\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":19995,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/19932\/revisions\/19995"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/media\/19934"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=19932"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=19932"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=19932"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}