{"id":138860,"date":"2024-05-27T06:00:44","date_gmt":"2024-05-27T04:00:44","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/?p=138860"},"modified":"2024-10-28T14:11:55","modified_gmt":"2024-10-28T13:11:55","slug":"dr-bartha-aron-az-elmeleti-kutatas-mellett-mindig-tudtam-hogy-betegekkel-szeretnek-foglalkozni","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/2024\/05\/27\/dr-bartha-aron-az-elmeleti-kutatas-mellett-mindig-tudtam-hogy-betegekkel-szeretnek-foglalkozni\/","title":{"rendered":"Dr. Bartha \u00c1ron: \u201eAz elm\u00e9leti kutat\u00e1s mellett mindig tudtam, hogy betegekkel szeretn\u00e9k foglalkozni\u201d"},"content":{"rendered":"
T\u00f6bb mint 20 daganatt\u00edpus g\u00e9nexpresszi\u00f3 szint\u0171 elemz\u00e9se v\u00e1lik lehet\u0151v\u00e9, valamint publik\u00e1l\u00e1sra k\u00e9sz \u00e1br\u00e1k is k\u00e9sz\u00edthet\u0151k a TNMplot webes alkalmaz\u00e1s \u00e1ltal. A webfel\u00fcletet dr. Bartha \u00c1ron \u00e9s koll\u00e9g\u00e1i fejlesztett\u00e9k a Semmelweis Egyetem Bioinformatika Tansz\u00e9k\u00e9n. A g\u00e9nek szekven\u00e1l\u00e1s\u00e1n alapul\u00f3, nagyadatok elemz\u00e9s\u00e9t v\u00e9gz\u0151 alkalmaz\u00e1st eddig t\u00f6bb mint 100 orsz\u00e1gban, k\u00f6zel 30 ezren haszn\u00e1lt\u00e1k m\u00e1r. Az alkalmaz\u00e1s l\u00e9trehoz\u00e1s\u00e1\u00e9rt a kutat\u00f3 2023-ban elnyerte a Semmelweis Innov\u00e1ci\u00f3s D\u00edjat<\/a> PhD-kateg\u00f3ri\u00e1ban.<\/div>\n

\u201eKutat\u00e1som l\u00e9nyege alapvet\u0151en az, hogy \u00f6sszehasonl\u00edtom, bizonyos g\u00e9nekb\u0151l mennyivel van t\u00f6bb vagy kevesebb a tumoros sz\u00f6vetben, mint az eg\u00e9szs\u00e9gesben\u201d \u2013 kezdte az \u00e1ltala fejlesztett TNMplot.com alkalmaz\u00e1s \u00e9s a m\u00f6g\u00f6tte \u00e1ll\u00f3 \u00f6sszetett elm\u00e9leti h\u00e1tt\u00e9r felhaszn\u00e1l\u00f3i szint\u0171 bemutat\u00e1s\u00e1t dr. Bartha \u00c1ron.\u00a0<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

A kutat\u00f3 tetsz\u0151legesen kiv\u00e1laszt egy g\u00e9nt, p\u00e9ld\u00e1ul a top2a-t \u00e9s a vastagb\u00e9l adenokarcin\u00f3ma k\u00f3rk\u00e9pet, a start gombbal elind\u00edtja az elemz\u00e9st a fel\u00fcleten, majd egy kis id\u0151 eltelt\u00e9vel megjelenik egy grafikus k\u00e9p, ahol l\u00e1that\u00f3v\u00e1 v\u00e1lik, hogy ebb\u0151l a g\u00e9nb\u0151l a tumorban mennyi mRNS fejez\u0151dik ki, \u00e9s mennyi a norm\u00e1l mint\u00e1ban. A program ezzel egy\u00fctt elv\u00e9gez egy statisztikai elemz\u00e9st, hogy ez a k\u00fcl\u00f6nbs\u00e9g szignifik\u00e1ns-e vagy sem \u2013 szeml\u00e9ltette.<\/p>\n

\n

Dr. Bartha \u00c1ron 2018-ban v\u00e9gezett a Semmelweis Egyetem \u00c1ltal\u00e1nos Orvostudom\u00e1nyi Kar\u00e1n. 2014 \u00f3ta kutat a dr. Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs egyetemi tan\u00e1r vezette Onkol\u00f3giai Biomarker kutat\u00f3csoportban, a Bioinformatika Tansz\u00e9ken. Tudom\u00e1nyos p\u00e1ly\u00e1j\u00e1t medikus hallgat\u00f3k\u00e9nt kezdte, tudom\u00e1nyos di\u00e1kk\u00f6ri kutat\u00e1saiban eml\u0151tumoros sejtvonalakkal foglalkozott: m\u00e1r elfogadott gy\u00f3gyszerek mell\u00e9khat\u00e1s profilj\u00e1t vizsg\u00e1lta \u00e9s azt a koncentr\u00e1ci\u00f3t, ahol ezek a gy\u00f3gyszerek daganatellenes ter\u00e1piak\u00e9nt hathatnak. PhD-tanulm\u00e1nyait 2018-ban kezdte meg, akkor indult a mostani, RNS szekven\u00e1l\u00e1son alapul\u00f3 bioinformatikai jelleg\u0171 kutat\u00e1sa, melyet az\u00f3ta is folytat. Mint elmondta, sok \u00faj feladatot jelent sz\u00e1m\u00e1ra, hogy 2023 szeptembert\u0151l a Gyermekgy\u00f3gy\u00e1szati Klinika rezidensek\u00e9nt dolgozik.<\/p>\n<\/div>\n

A TNMplot.com<\/a> egy olyan webes alkalmaz\u00e1s, amelyet a kutat\u00f3k saj\u00e1t kutat\u00e1saik valid\u00e1l\u00e1s\u00e1ra haszn\u00e1lhatnak, de ak\u00e1r arra is, hogy a kutat\u00e1sok elej\u00e9n \u00f6tletet gy\u0171jtsenek, vagy esetleg a hipot\u00e9ziseiket \u00edgy tesztelj\u00e9k \u2013 fejtette ki dr. Bartha \u00c1ron. A webfel\u00fclet alapj\u00e1ul szolg\u00e1l\u00f3 adatb\u00e1zisban RNS szekven\u00e1l\u00e1s \u00e9s g\u00e9n chip alap\u00fa adatok is el\u00e9rhet\u0151ek, melyeket nemzetk\u00f6zi adatrepozit\u00f3riumokr\u00f3l t\u00f6lt\u00f6ttek le.<\/p>\n

A TNMplot alkalmaz\u00e1s k\u00e9pes arra, hogy egym\u00e1s mellett k\u00e9t elemz\u00e9si lehet\u0151s\u00e9g t\u00f6rt\u00e9njen, ami egyed\u00fcl\u00e1ll\u00f3 dolog: a kutat\u00f3nak lehet\u0151s\u00e9ge van arra, hogy egy adott g\u00e9nt k\u00e9t k\u00fcl\u00f6n betegpopul\u00e1ci\u00f3n \u00e9s k\u00e9t teljesen elt\u00e9r\u0151 platformon is meg tudjon vizsg\u00e1lni. Ha ez a g\u00e9n az elt\u00e9r\u0151 popul\u00e1ci\u00f3n \u00e9s elt\u00e9r\u0151 platformon is ugyanazt az eredm\u00e9nyt mutatja, akkor nagyobb es\u00e9llyel lehet ennek klinikai vagy biol\u00f3giai jelent\u0151s\u00e9ge. Hozz\u00e1tette, webes elemz\u0151 programokb\u00f3l sok van szerte a vil\u00e1gon. Az \u00e1ltaluk l\u00e9trehozott TNMplot az\u00e9rt is egyed\u00fcl\u00e1ll\u00f3, mert m\u00edg m\u00e1s, ehhez hasonl\u00f3 fel\u00fcleteken 20 ezer, de maximum 30 ezer minta tal\u00e1lhat\u00f3, itt mintegy 60 ezer mint\u00e1b\u00f3l dolgozik a program.<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Dr. Bartha \u00c1ron 2018-ban kezdett el a webes projekttel foglalkozni, az adatb\u00e1zisuk fel\u00e9p\u00edt\u00e9s\u00e9hez \u00e1t kellett n\u00e9zni mintegy 3 ezer publik\u00e1ci\u00f3t, \u00e9s a hozz\u00e1 tartoz\u00f3 dokument\u00e1ci\u00f3kat. \u201eK\u00f6vetkez\u0151 l\u00e9p\u00e9sk\u00e9nt elk\u00e9sz\u00edtett\u00fck koll\u00e9g\u00e1immal ennek a programoz\u00e1si h\u00e1tter\u00e9t, \u00e9s meg\u00edrtuk azokat a funkci\u00f3kat \u00e9s algoritmusokat, amik ezeket m\u0171k\u00f6dtetik, tov\u00e1bb\u00e1 t\u00e9mavezet\u0151mmel, Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs professzorral egy angol nyelv\u0171 cikket \u00edrtunk k\u00f6z\u00f6sen, ami 2021 m\u00e1rcius\u00e1ban jelent meg egy nemzetk\u00f6zi foly\u00f3iratban<\/a>. Ez volt a projekt els\u0151 nagy m\u00e9rf\u00f6ldk\u00f6ve, jelenleg pedig m\u00e1r dolgozunk a k\u00f6vetkez\u0151 cikken” \u2013 r\u00e9szletezte a folyamatot.<\/p>\n

\n

Mindig is \u00e9rdekelt a r\u00e1kkutat\u00e1s, azt pedig m\u00e1r az egyetem el\u0151tt is tudtam, hogy az onkol\u00f3gia klinikai \u00e9s elm\u00e9leti r\u00e9sz\u00e9vel is sz\u00edvesen foglalkozn\u00e9k<\/p>\n<\/blockquote>\n

\u2013 mes\u00e9lt a motiv\u00e1ci\u00f3j\u00e1r\u00f3l a szakember.\u00a0<\/p>\n

\u201eEgy jelent\u0151s pillanat, ami elmozd\u00edtott ebbe az ir\u00e1nyba, a gimn\u00e1zium alatt v\u00e9gzett \u00f6nk\u00e9ntes munka volt, amely sor\u00e1n a hospice-t v\u00e1lasztottam\u201d \u2013 emelte ki, hozz\u00e1t\u00e9ve, onnant\u00f3l kezdve \u00e9rdekelte az onkol\u00f3gia. Az orvosl\u00e1shoz vezet\u0151 \u00faton \u00e9desanyja adta az els\u0151 \u00e9s legfontosabb benyom\u00e1st, aki h\u00e1ziorvosk\u00e9nt mindig al\u00e1zattal \u00e9s nagy szakmai alaposs\u00e1ggal fordult betegei fel\u00e9. Jelent\u0151s hat\u00e1ssal volt r\u00e1 tov\u00e1bb\u00e1 nagyapja, akinek a mikroszk\u00f3pj\u00e1ba belen\u00e9zhetett gyerekkor\u00e1ban, \u00e9s aki annak idej\u00e9n elkezdett kutat\u00e1ssal foglalkozni, de az akkori rendszerben nem volt lehet\u0151s\u00e9ge kibontakoztatni azt a v\u00e1lasztott ter\u00fclet\u00e9n, ami most neki, az unok\u00e1j\u00e1nak megadatott \u2013 eml\u00e9kezett a kutat\u00f3.<\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

A Bioinformatika Tansz\u00e9kre ker\u00fclve elkezdte megtanulni a szakter\u00fclet m\u00f3dszertan\u00e1t \u00e9s alkalmaz\u00e1s\u00e1t, a tov\u00e1bbiakban k\u00fclf\u00f6ldi kurzusokon b\u0151v\u00edtette ismereteit. Ezt k\u00f6vet\u0151en a New York Egyetem (NYU) vend\u00e9gkutat\u00f3ja volt, ahol nem g\u00e9nexpresszi\u00f3s, hanem protemikai adatok elemz\u00e9s\u00e9vel, a proteinek poszttranszl\u00e1ci\u00f3s modifik\u00e1ci\u00f3inak daganatos valamint eg\u00e9szs\u00e9ges sz\u00f6vetekben t\u00f6rt\u00e9n\u0151 \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1s\u00e1val foglalkozott.<\/p>\n

Mint kiemeli, h\u00e1l\u00e1s t\u00e9mavezet\u0151j\u00e9nek, dr. Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs tansz\u00e9kvezet\u0151 egyetemi tan\u00e1rnak, akit\u0151l nagyon sok seg\u00edts\u00e9get \u00e9s inspir\u00e1ci\u00f3t kapott. Hozz\u00e1tette: \u201eAz elm\u00e9leti munka mellett mindig is tudtam, hogy az \u00e9letem egy pontj\u00e1n el\u0151bb-ut\u00f3bb el fogok jutni oda, hogy betegekkel foglalkozzak.\u201d 2023 \u0151sz\u00e9n elkezdhette szakorvosi k\u00e9pz\u00e9s\u00e9t a gyermekgy\u00f3gy\u00e1szat ter\u00fclet\u00e9n.\u00a0<\/p>\n

\n

B\u00edzom benne, hogy lesznek olyan pontjai a munk\u00e1mnak, ahol a klinikum \u00e9s a kutat\u00e1s \u00f6ssze\u00e9r<\/p>\n<\/blockquote>\n

\u2013 hangs\u00falyozta.\u00a0Tapasztalata szerint az onkol\u00f3gia olyan ter\u00fclet, ahol \u00f6ssze tud \u00e9rni.\u00a0<\/p>\n

Sz\u00e1mos elfoglalts\u00e1ga mellett a programoz\u00e1s \u00e9s az adatbevitel azzal egy\u00fctt, hogy folyamatos feladatot ad sz\u00e1m\u00e1ra, \u00e9s jav\u00edtand\u00f3 hib\u00e1k is ad\u00f3dnak sz\u00e9p sz\u00e1mmal, kikapcsolja \u00e9s seg\u00edti f\u00f3kusz\u00e1lni is. A honlap\u00e9p\u00edt\u00e9st kreat\u00edv tev\u00e9kenys\u00e9gk\u00e9nt \u00e9li meg; \u00e9p\u00edt\u0151kock\u00e1khoz hasonl\u00edtotta az elemeket, \u00e9s mint mondta, ha valaki szeret leg\u00f3zni, akkor ezt hasonl\u00f3an lehet elk\u00e9pzelni, csak egy kicsit bonyolultabb form\u00e1ban \u2013 fogalmazott.<\/p>\n

\n

Az eddigi munk\u00e1j\u00e1nak eredm\u00e9ny\u00e9t jelzi, hogy szakcikk\u00fck id\u00e9zetts\u00e9ge m\u00e1r j\u00f3val 400 f\u00f6l\u00f6tt j\u00e1r, \u00e9s a webes alkalmaz\u00e1st a Google Analytics adatai szerint t\u00f6bb mint sz\u00e1z orsz\u00e1gban haszn\u00e1lt\u00e1k, de legnagyobbr\u00e9szt K\u00edn\u00e1b\u00f3l \u00e9s az Egyes\u00fclt \u00c1llamokb\u00f3l.<\/p>\n<\/div>\n

\n

Dr. Bartha \u00c1ron elmondta, hosszabb t\u00e1v\u00fa c\u00e9lja, hogy gyermekgy\u00f3gy\u00e1sz szakorvos legyen, majd a gyermek hemato-onkol\u00f3gia szakk\u00e9pes\u00edt\u00e9st is megszerezze, \u00edgy m\u00e1r sz\u00e1mos olyan lehet\u0151s\u00e9ge lenne, ahol a c\u00e9lzott ter\u00e1pi\u00e1kat alkalmazni lehet, tov\u00e1bb\u00e1 a kutat\u00f3i szeml\u00e9let\u00e9t is j\u00f3l kamatoztathatja ezeken a ter\u00fcleteken.<\/p>\n<\/div>\n

\u201eJelenleg m\u00e1r folyamatban van egy \u00fajabb fejleszt\u00e9s\u00fcnk: eddig a norm\u00e1l \u00e9s tumoros sz\u00f6vetet lehet \u00f6sszehasonl\u00edtani a programmal, de olyan klinikai v\u00e1ltoz\u00f3kat m\u00e9g nem tud figyelembe venni az alkalmaz\u00e1s, hogy egy adott t\u00edpus\u00fa tumor milyen st\u00e1dium\u00fa. Most azon dolgozunk, hogy ez alapj\u00e1n is lehessen adatot elemezni. Hossz\u00fa t\u00e1von szeretn\u00e9m, hogy ne csak mRNS-adatokat lehessen itt megn\u00e9zni, hanem azt is, hogy ugyanez hogy n\u00e9z ki a proteinek szintj\u00e9n is, hiszen a sejtszint\u0171 folyamatok meg\u00e9rt\u00e9s\u00e9ben kulcsszerep\u00fck van a feh\u00e9rj\u00e9knek\u201d \u2013 magyar\u00e1zta.<\/p>\n

\n

A Semmelweis Innov\u00e1ci\u00f3s D\u00edj adom\u00e1nyoz\u00e1s\u00e1val a Semmelweis Egyetem minden \u00e9vben azon kutat\u00f3k, PhD- \u00e9s TDK-hallgat\u00f3k kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9si, innov\u00e1ci\u00f3s tev\u00e9kenys\u00e9g\u00e9t ismeri el, akik az egyetemhez k\u00f6t\u0151d\u0151 kutat\u00f3munk\u00e1juk sor\u00e1n \u00faj, tudom\u00e1nyos kutat\u00e1si eredm\u00e9nyeket, innovat\u00edv megold\u00e1sokat dolgoztak ki. A d\u00edj p\u00e9nzjutalommal j\u00e1r \u00e9s minden \u00e9vben h\u00e1rom p\u00e1ly\u00e1zati kateg\u00f3ri\u00e1ban hirdetik meg.<\/p>\n

Megjelent a 2024-es Semmelweis Innov\u00e1ci\u00f3s D\u00edj p\u00e1ly\u00e1zati ki\u00edr\u00e1sa.
\nBeny\u00fajt\u00e1si hat\u00e1rid\u0151: 2024. j\u00fanius 30. (vas\u00e1rnap)
\n<\/strong>A p\u00e1ly\u00e1zati felh\u00edv\u00e1s \u00e9s a p\u00e1ly\u00e1zati adatlap el\u00e9rhet\u0151 az egyetem honlapj\u00e1n.<\/a><\/p>\n<\/div>\n

Tasn\u00e1di R\u00f3bert
\nFot\u00f3: Barta B\u00e1lint \u2013 Semmelweis Egyetem<\/p>\n\r\n [slb_exclude]\r\n

\r\n
\r\n \r\n\t\t\t\t
\"\"<\/a><\/div>\r\n <\/span>\r\n\r\n <\/div>\r\n\r\n\t\t\t
\r\n\t\t\t\t
\r\n
\r\n\t\t\t\t\t

Gal\u00e9ria<\/h3>\r\n\t\t\t\t\t
\r\n\r\n\t\t\t\t\t\t
7<\/span>k\u00e9p<\/div>\r\n <\/div> <\/div>\r\n \r\n\t\t\t\t\t
\"\"<\/a><\/div>\r\n <\/span>\r\n \r\n\t\t\t\t\t
\"\"<\/a><\/div>\r\n <\/span>\r\n\r\n <\/div>\r\n\r\n <\/div>\r\n\r\n
\r\n \"\"\r\n <\/a><\/div><\/span>
\r\n \"\"\r\n <\/a><\/div><\/span>
\r\n \"\"\r\n <\/a><\/div><\/span>
\r\n \"\"\r\n <\/a><\/div><\/span>\r\n <\/div>\r\n\r\n [\/slb_exclude]\r\n\t\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

A kutat\u00f3 a TNMplot webes alkalmaz\u00e1s kifejleszt\u00e9s\u00e9\u00e9rt nyerte el a Semmelweis Innov\u00e1ci\u00f3s D\u00edjat.<\/p>\n","protected":false},"author":102073,"featured_media":138872,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[157,168],"tags":[4179,4157,4351,3996,2408,189],"class_list":["post-138860","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-semmelweis-vilag","category-kiemelt","tag-alhonlapokra","tag-innovacio","tag-innovacios-dij-2023","tag-interju","tag-mki-alairas"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/138860","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/users\/102073"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=138860"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/138860\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":140424,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/138860\/revisions\/140424"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/media\/138872"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=138860"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=138860"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/hirek\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=138860"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}