{"id":7729,"date":"2021-12-22T15:38:15","date_gmt":"2021-12-22T14:38:15","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/?p=7729"},"modified":"2022-04-01T13:44:11","modified_gmt":"2022-04-01T11:44:11","slug":"dr-menyhart-otilia-2-cikke-is-megjelent-az-tudomanyos-hiradoban","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/dr-menyhart-otilia-2-cikke-is-megjelent-az-tudomanyos-hiradoban\/","title":{"rendered":"A Tudom\u00e1nyos H\u00edrad\u00f3 is besz\u00e1molt Dr. Menyhart Ot\u00edlia 2 megjelent cikk\u00e9r\u0151l…"},"content":{"rendered":"
Multiple-testing |<\/h5>\n

\"\"<\/a>Szinte minden tudom\u00e1ny\u00e1gban dolgoz\u00f3 kutat\u00f3 szembes\u00fcl azzal a probl\u00e9m\u00e1val, hogy sz\u00e1mos hipot\u00e9zis egyidej\u0171 \u00e9rt\u00e9kel\u00e9se sor\u00e1n megn\u0151 a fals pozit\u00edv eredm\u00e9nyek ar\u00e1nya, ugyanis a t\u00f6bbsz\u00f6r\u00f6s \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1s n\u00f6veli a val\u00f3tlan asszoci\u00e1ci\u00f3k lehet\u0151s\u00e9g\u00e9t. A probl\u00e9ma megold\u00e1s\u00e1ra sz\u00e1mos korrekci\u00f3s strat\u00e9gia l\u00e9tezik. K\u00f6zlem\u00e9ny\u00fcnkben \u00f6sszefoglaltuk a legfontosabb statisztikai fogalmakat \u00e9s l\u00e9p\u00e9sr\u0151l l\u00e9p\u00e9sre ismertett\u00fck a leggyakrabban alkalmazott korrekci\u00f3s m\u00f3dszereket. Az alkalmazott strat\u00e9gi\u00e1kat \u00e9rthet\u0151 p\u00e9ld\u00e1kkal illusztr\u00e1lva egy k\u00f6nnyen k\u00f6vethet\u0151 \u00fatmutat\u00f3t hoztunk l\u00e9tre a megfelel\u0151 korrekci\u00f3s technika kiv\u00e1laszt\u00e1s\u00e1hoz.<\/p>\n

Ezen fel\u00fcl egy teljesen automatiz\u00e1lt megold\u00e1st is k\u00edn\u00e1lunk a probl\u00e9ma megold\u00e1s\u00e1ra. Az \u00e1ltalunk l\u00e9trehozott felhaszn\u00e1l\u00f3bar\u00e1t, regisztr\u00e1ci\u00f3-mentes online eszk\u00f6z a\u00a0www.multipletesting.com<\/a>\u00a0c\u00edmen \u00e9rhet\u0151 el, melynek haszn\u00e1lata programoz\u00e1si ismereteket nem ig\u00e9nyel. Az online fel\u00fclet lehet\u0151v\u00e9 teszi az \u00f6t leggyakrabban haszn\u00e1lt korrekci\u00f3s m\u00f3dszer (Bonferroni-, Holm-,Hochberg-korrekci\u00f3, FDR \u00e9s q-\u00e9rt\u00e9k) gyors haszn\u00e1lat\u00e1t. Fejleszt\u00e9s\u00fcnk val\u00f3di hi\u00e1nyp\u00f3tl\u00f3 megold\u00e1st ny\u00fajthat az \u00e9lettudom\u00e1nyban dolgoz\u00f3 kutat\u00f3k sz\u00e1m\u00e1ra \u2013 fogalmazott \u00f6sszefoglal\u00f3j\u00e1ban dr. Menyh\u00e1rt Ot\u00edlia.<\/p>\n

\n

MultipleTesting.com: A tool for life science researchers for multiple hypothesis testing correction
\nOt\u00edlia Menyhart (Department of Bioinformatics, Semmelweis University), Bogl\u00e1rka Weltz (Research Centre for Natural Sciences, Cancer Biomarker Research Group, Institute of Enzymology), Bal\u00e1zs Gy\u0151rffy (Department of Bioinformatics, Semmelweis University)
\nPLoS ONE 16(6): e0245824.\u00a0https:\/\/doi.org\/10.1371\/journal.pone.0245824<\/a><\/p>\n<\/div>\n

 <\/p>\n

Multi-omika<\/h5>\n

A hatalmas adatt\u00f6meget gener\u00e1l\u00f3, nagy \u00e1tereszt\u0151k\u00e9pess\u00e9g\u0171 m\u00f3dszerek sz\u00e9les k\u00f6r\u0171 elterjed\u00e9se lehet\u0151s\u00e9get ny\u00fajt a sejten bel\u00fcli molekul\u00e1ris szervez\u0151d\u00e9s r\u00e9szletes elemz\u00e9s\u00e9re. A genom, transzkriptom, proteom, metabolom \u00e9s mikrobiom k\u00fcl\u00f6n\u00e1ll\u00f3 vizsg\u00e1lata nem felt\u00e9tlen\u00fcl vezet ok-okozati \u00f6sszef\u00fcgg\u00e9sek felt\u00e1r\u00e1s\u00e1hoz, ezen szervez\u0151d\u00e9si szintek integr\u00e1l\u00e1sa azonban p\u00e1ratlan lehet\u0151s\u00e9get k\u00edn\u00e1l komplex megbeteged\u00e9sek, mint p\u00e9ld\u00e1ul a rosszindulat\u00fa daganatok h\u00e1tter\u00e9ben \u00e1ll\u00f3 mechanizmusok meg\u00e9rt\u00e9s\u00e9re.\u00a0<\/p>\n

\u00d6sszefoglal\u00f3 k\u00f6zlem\u00e9ny\u00fcnkben bemutattuk a multi-omika ny\u00fajtotta lehet\u0151s\u00e9geket a tumorok oszt\u00e1lyoz\u00e1s\u00e1ban, a diagnosztik\u00e1ban \u00e9s a progn\u00f3zis fel\u00e1ll\u00edt\u00e1s\u00e1ban, valamint ismertett\u00fck az adatintegr\u00e1ci\u00f3ban haszn\u00e1latos algoritmusokat. Taglaltuk az egyes omikai strat\u00e9gi\u00e1k klinikumot \u00e9rint\u0151 eredm\u00e9nyeit, \u00e9s az elterjed\u00e9s\u00fck el\u0151tt \u00e1ll\u00f3 f\u0151 kih\u00edv\u00e1sokat.Jelenleg a multi-omikai megk\u00f6zel\u00edt\u00e9s sz\u00e9les k\u00f6rben val\u00f3 elterjed\u00e9s\u00e9nek egyik f\u0151 akad\u00e1lya a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 omikai m\u00f3dszerek egyenetlen \u00e9retts\u00e9ge, valamint az adatok el\u0151\u00e1ll\u00edt\u00e1sa \u00e9s feldolgoz\u00e1sa k\u00f6z\u00f6tti szakad\u00e9k. Az elm\u00e9leti meg\u00e1llap\u00edt\u00e1sok klinikai implement\u00e1ci\u00f3j\u00e1hoz n\u00e9lk\u00fcl\u00f6zhetetlen a mintafeldolgoz\u00e1si \u00e9s elemz\u00e9si folyamatok szabv\u00e1nyos\u00edt\u00e1sa, illetve a multidiszciplin\u00e1risan k\u00e9pzett szak\u00e9rt\u0151k jelenl\u00e9te \u2013 mutatott r\u00e1 \u00f6sszefoglal\u00f3j\u00e1ban dr. Menyh\u00e1rt Ot\u00edlia.<\/p>\n

\n

Multi-omics approaches in cancer research with applications in tumor subtyping, prognosis, and diagnosis
\nOt\u00edlia Menyh\u00e1rt (Semmelweis University, Department of Bioinformatics and 2nd Department of Pediatrics; Research Centre for Natural Sciences, Cancer Biomarker Research Group, Institute of Enzymology), Bal\u00e1zs Gy\u0151rffy (Semmelweis University, Department of Bioinformatics and 2nd Department of Pediatrics; Research Centre for Natural Sciences, Cancer Biomarker Research Group, Institute of Enzymology)
\nComputational and Structural Biotechnology Journal (2021), Volume 19, Pages 949-960
\nhttps:\/\/doi.org\/10.1016\/j.csbj.2021.01.009<\/a>.<\/p>\n<\/div>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

Semmelweis Egyetem Tudom\u00e1nyos H\u00edrad\u00f3 7.<\/a><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Multiple-testing | <\/a> Szinte minden tudom\u00e1ny\u00e1gban dolgoz\u00f3 kutat\u00f3 szembes\u00fcl azzal a probl\u00e9m\u00e1val, hogy sz\u00e1mos hipot\u00e9zis egyidej\u0171 \u00e9rt\u00e9kel\u00e9se sor\u00e1n megn\u0151 a fals pozit\u00edv eredm\u00e9nyek ar\u00e1nya, ugyanis a t\u00f6bbsz\u00f6r\u00f6s \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1s n\u00f6veli a val\u00f3tlan asszoci\u00e1ci\u00f3k lehet\u0151s\u00e9g\u00e9t. A probl\u00e9ma megold\u00e1s\u00e1ra sz\u00e1mos korrekci\u00f3s strat\u00e9gia l\u00e9tezik. K\u00f6zlem\u00e9ny\u00fcnkben \u00f6sszefoglaltuk a legfontosabb statisztikai fogalmakat \u00e9s l\u00e9p\u00e9sr\u0151l l\u00e9p\u00e9sre ismertett\u00fck a leggyakrabban alkalmazott korrekci\u00f3s m\u00f3dszereket. Az …<\/p>\n","protected":false},"author":101779,"featured_media":8107,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-7729","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-hirek"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7729","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/users\/101779"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=7729"}],"version-history":[{"count":9,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7729\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":8108,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/7729\/revisions\/8108"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media\/8107"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=7729"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=7729"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=7729"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}