{"id":10575,"date":"2024-10-16T11:00:15","date_gmt":"2024-10-16T09:00:15","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/?p=10575"},"modified":"2024-11-04T08:46:50","modified_gmt":"2024-11-04T07:46:50","slug":"uj-cikk-kerult-elfogadasra-a-nucleic-acids-research-adatbazis-kulonszamaban-dr-tusnadi-gabor-kozlemenye","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/uj-cikk-kerult-elfogadasra-a-nucleic-acids-research-adatbazis-kulonszamaban-dr-tusnadi-gabor-kozlemenye\/","title":{"rendered":"\u00daj cikk ker\u00fclt elfogad\u00e1sra a Nucleic Acids Research Adatb\u00e1zis k\u00fcl\u00f6nsz\u00e1m\u00e1ban, Dr. Tusn\u00e1dy G\u00e1bor k\u00f6zlem\u00e9nye"},"content":{"rendered":"

\"\"\"\"A <\/span><\/span>Nucleic<\/span> Acids<\/span> Research Adatb\u00e1zis<\/span><\/span><\/em> k\u00fcl\u00f6nsz\u00e1m\u00e1ban elfogadt\u00e1k <\/span><\/span>Dr<\/span>.<\/span> Tusn\u00e1dy<\/span> G\u00e1bor<\/span><\/span> \u00e9s <\/span><\/span>Dr<\/span>.<\/span> Dobson<\/span> L\u00e1szl\u00f3 <\/span><\/span><\/strong>k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9vel k\u00e9sz\u00fclt cikket.<\/span><\/span><\/p>\n

M\u00edg az eddig meghat\u00e1rozott szerkezet\u0171 feh\u00e9rje t\u00f6bbs\u00e9ge k\u00e9pes \u00f6n\u00e1ll\u00f3an \u00f6sszetekeredni \u00e9s m\u00e1s feh\u00e9rj\u00e9kkel a feltekered\u00e9s ut\u00e1n k\u00f6lcs\u00f6nhat\u00e1sba l\u00e9pni, az ismert feh\u00e9rjekomplexek egy r\u00e9szhalmaza olyan feh\u00e9rjel\u00e1ncokat tartalmaz, amelyek \u00f6nmagukban nem k\u00e9pesek id\u0151ben \u00e1lland\u00f3 t\u00e9rszerkezetet kialak\u00edtani, rendezetlenek. A Mutual Folding Induced by Binding (MFIB)<\/em> adatb\u00e1zisban ezeket a feh\u00e9rj\u00e9ket gy\u0171jt\u00f6tt\u00fck \u00f6ssze a HUN-REN Term\u00e9szettudom\u00e1nyi Kutat\u00f3k\u00f6zpont munkat\u00e1rsaival<\/strong> val\u00f3 egy\u00fcttm\u0171k\u00f6d\u00e9sben \u00e9s oszt\u00e1lyoztuk ezeket a feh\u00e9rjekomplexeket, teh\u00e1t amelyekben a feh\u00e9rj\u00e9t alkot\u00f3 \u00f6sszes feh\u00e9rjel\u00e1nc \u00f6nmag\u00e1ban rendezetlen lenne, de k\u00f6t\u00e9skor j\u00f3l defini\u00e1lt 3D komplex szerkezetbe tekerednek. Ezt a jelens\u00e9get gyakran nevezik kooperat\u00edv feltekered\u00e9s \u00e9s k\u00f6t\u0151d\u00e9snek vagy k\u00f6lcs\u00f6n\u00f6s szinergikus feltekered\u00e9snek (MSF). Ebben a munk\u00e1ban jelent\u0151s m\u00e9rt\u00e9kben n\u00f6velt\u00fck az adatok sz\u00e1m\u00e1t: t\u00f6bb sz\u00e1z \u00faj, az MSF krit\u00e9riumainak megfelel\u0151 feh\u00e9rjekomplexet gy\u0171jt\u00f6tt\u00fcnk \u00f6ssze \u00e9s annot\u00e1ltunk, ami az adatb\u00e1zis m\u00e9ret\u00e9nek k\u00f6zel hatszoros n\u00f6veked\u00e9s\u00e9hez vezetett. Sz\u00e1mos \u00faj funkci\u00f3t is bevezett\u00fcnk, mint p\u00e9ld\u00e1ul a komplexek klaszterez\u00e9s\u00e9t szerkezeti hasonl\u00f3s\u00e1g \u00e9s dom\u00e9n t\u00edpusok alapj\u00e1n, az egyes bejegyz\u00e9sekhez k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 bizony\u00edt\u00e1si szinteket \u00e9s evidencia \u00e9rt\u00e9ket rendelt\u00fcnk hozz\u00e1, amely lehet\u0151v\u00e9 tette, hogy a t\u00f6bb(al)dom\u00e9nes monomerek komplexeit r\u00e9szleges MSF-k\u00e9nt kezelj\u00fck.<\/p>\n

Az MFIB 2.0 adatb\u00e1zis a https:\/\/mfib.pbrg.hu<\/a> c\u00edmen \u00e9rhet\u0151 el.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

A Nucleic Acids Research Adatb\u00e1zis k\u00fcl\u00f6nsz\u00e1m\u00e1ban elfogadt\u00e1k Dr. Tusn\u00e1dy G\u00e1bor \u00e9s Dr. Dobson L\u00e1szl\u00f3 k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u00e9s\u00e9vel k\u00e9sz\u00fclt cikket. M\u00edg az eddig meghat\u00e1rozott szerkezet\u0171 feh\u00e9rje t\u00f6bbs\u00e9ge k\u00e9pes \u00f6n\u00e1ll\u00f3an \u00f6sszetekeredni \u00e9s m\u00e1s feh\u00e9rj\u00e9kkel a feltekered\u00e9s ut\u00e1n k\u00f6lcs\u00f6nhat\u00e1sba l\u00e9pni, az ismert feh\u00e9rjekomplexek egy r\u00e9szhalmaza olyan feh\u00e9rjel\u00e1ncokat tartalmaz, amelyek \u00f6nmagukban nem k\u00e9pesek id\u0151ben \u00e1lland\u00f3 t\u00e9rszerkezetet kialak\u00edtani, rendezetlenek. A Mutual Folding …<\/p>\n","protected":false},"author":102018,"featured_media":10615,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-10575","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-hirek"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10575","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/users\/102018"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=10575"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10575\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10618,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10575\/revisions\/10618"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media\/10615"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=10575"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=10575"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=10575"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}