{"id":10463,"date":"2024-09-11T19:55:29","date_gmt":"2024-09-11T17:55:29","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/?p=10463"},"modified":"2024-09-13T09:24:29","modified_gmt":"2024-09-13T07:24:29","slug":"a-rangos-journal-of-pharmaceutical-analysis-folyoirat-elfogadta-menyhart-otilia-kothalawala-william-es-gyorffy-balazs-a-gene-set-enrichment-analysis-for-the-cancer-hallmarks","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/a-rangos-journal-of-pharmaceutical-analysis-folyoirat-elfogadta-menyhart-otilia-kothalawala-william-es-gyorffy-balazs-a-gene-set-enrichment-analysis-for-the-cancer-hallmarks\/","title":{"rendered":"A Journal of Pharmaceutical Analysis\u00a0foly\u00f3iratban megjelent  Menyhart Ot\u00edlia k\u00f6zlem\u00e9nye"},"content":{"rendered":"<p><span style=\"font-size: 18pt\"><strong><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" class=\" wp-image-10474 alignleft\" src=\"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/files\/2024\/09\/OtiwilliamProf.jpg\" alt=\"\" width=\"333\" height=\"444\" \/>A rangos\u00a0<em>Journal of Pharmaceutical Analysis<\/em> foly\u00f3irat (IF 2023: 6,1) elfogadta Menyhart Ot\u00edlia, Kothalawala William \u00e9s Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs \u201eA gene set enrichment analysis for the cancer hallmarks\u201d c\u00edm\u0171 k\u00f6zlem\u00e9ny\u00e9t<\/strong><\/span><\/p>\n<p>A tumorokban tal\u00e1lhat\u00f3 nagy diverzit\u00e1s ellen\u00e9re k\u00f6z\u00f6s szervez\u0151d\u00e9si elvek jellemzik a r\u00e1kos daganatokat. Ilyen szervez\u0151d\u00e9si elvek p\u00e9ld\u00e1ul a sz\u00f6veti inv\u00e1zi\u00f3 \u00e9s \u00e1tt\u00e9tk\u00e9pz\u00e9s, a megv\u00e1ltozott anyagcsere, a sejthal\u00e1l elker\u00fcl\u00e9se, az \u00faj v\u00e9rerek k\u00e9pz\u0151d\u00e9se, vagy a korl\u00e1t n\u00e9lk\u00fcli sejtoszt\u00f3d\u00e1s. Elm\u00e9letben ezek a szervez\u0151d\u00e9si elvek \u00e9s a hozz\u00e1juk kapcsol\u00f3d\u00f3 g\u00e9nk\u00e9szletek \u00edg\u00e9retes keretet ny\u00fajtanak a r\u00e1k egys\u00e9ges tanulm\u00e1nyoz\u00e1s\u00e1ra, azonban ezt jelent\u0151sen megnehez\u00edti egy konszenzuson alapul\u00f3, az adott r\u00e1k jellemz\u0151kre (\u201challmarkokra\u201d) specifikus g\u00e9nk\u00e9szlet hi\u00e1nya.<\/p>\n<p>A szerz\u0151k a r\u00e1k jellemz\u0151inek jobb meg\u00e9rt\u00e9se \u00e9rdek\u00e9ben ezekhez a szervez\u0151d\u00e9si elvekhez tartoz\u00f3 specifikus g\u00e9nk\u00e9szletek meghat\u00e1roz\u00e1s\u00e1t t\u0171zt\u00e9k ki c\u00e9lul. Ennek \u00e9rdek\u00e9ben h\u00e9t k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 projekt eredm\u00e9nyeit egyes\u00edtett\u00e9k, \u00e9s t\u00edz r\u00e1kspecifikus jellemz\u0151h\u00f6z kapcsol\u00f3d\u00f3 6 763 g\u00e9nt azonos\u00edtottak.<\/p>\n<p>Ez az \u00e1tfog\u00f3 g\u00e9nk\u00e9szlet lehet\u0151s\u00e9get ny\u00fajt a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 daganatos megbeteged\u00e9sek kialakul\u00e1s\u00e1nak \u00e9s el\u0151rehalad\u00e1s\u00e1nak m\u00e9lyebb meg\u00e9rt\u00e9s\u00e9hez. A szerz\u0151k \u00e1ltal l\u00e9trehozott szabadon el\u00e9rhet\u0151 online fel\u00fclet (<a href=\"http:\/\/www.cancerhallmarks.com\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener noreferrer\">www.cancerhallmarks.com<\/a>) lehet\u0151v\u00e9 teszi a g\u00e9nk\u00e9szlet automatikus elemz\u00e9s\u00e9t. Ez hasznos eszk\u00f6z lehet minden kutat\u00f3 sz\u00e1m\u00e1ra, hiszen tetsz\u0151leges g\u00e9nlist\u00e1kb\u00f3l k\u00e9pes meghat\u00e1rozni, mely r\u00e1kspiecifikus jellemz\u0151k vannak t\u00fals\u00falyban a fel\u00fcletre felt\u00f6lt\u00f6tt g\u00e9nlist\u00e1ban, \u00e9s adott tumor t\u00edpusok eset\u00e9ben mely szervez\u0151d\u00e9si elvek kapj\u00e1k a legnagyobb hangs\u00falyt.<\/p>\n<p>A teljes cikk <a href=\"https:\/\/www.sciencedirect.com\/science\/article\/pii\/S209517792400162X\">ide<\/a> kattintva \u00e9rhet\u0151 el.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A rangos\u00a0Journal of Pharmaceutical Analysis foly\u00f3irat (IF 2023: 6,1) elfogadta Menyhart Ot\u00edlia, Kothalawala William \u00e9s Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs \u201eA gene set enrichment analysis for the cancer hallmarks\u201d c\u00edm\u0171 k\u00f6zlem\u00e9ny\u00e9t A tumorokban tal\u00e1lhat\u00f3 nagy diverzit\u00e1s ellen\u00e9re k\u00f6z\u00f6s szervez\u0151d\u00e9si elvek jellemzik a r\u00e1kos daganatokat. Ilyen szervez\u0151d\u00e9si elvek p\u00e9ld\u00e1ul a sz\u00f6veti inv\u00e1zi\u00f3 \u00e9s \u00e1tt\u00e9tk\u00e9pz\u00e9s, a megv\u00e1ltozott anyagcsere, a sejthal\u00e1l &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":102018,"featured_media":10470,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[2],"tags":[],"class_list":["post-10463","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-hirek"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10463","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/users\/102018"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=10463"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10463\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10475,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/10463\/revisions\/10475"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media\/10470"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=10463"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=10463"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=10463"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}