{"id":7287,"date":"2021-01-28T08:18:29","date_gmt":"2021-01-28T07:18:29","guid":{"rendered":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/?page_id=7287"},"modified":"2024-03-13T14:54:04","modified_gmt":"2024-03-13T13:54:04","slug":"onlab-temak","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/kutatas\/uj-kutatasi-temak\/onlab-temak\/","title":{"rendered":"\u00d6NLAB t\u00e9m\u00e1k"},"content":{"rendered":"
\n
\n
\n

P\u00e1zm\u00e1ny P\u00e9ter Katolikus Egyetem Inform\u00e1ci\u00f3s Technol\u00f3giai \u00e9s Bionikai Karon meghirdetett \u00d6NLAB t\u00e9m\u00e1k:<\/span><\/h2>\n<\/div>\n<\/div>\n<\/div>\n

 <\/p>\n

Tumoros \u00e9s norm\u00e1l sz\u00f6vetek elk\u00fcl\u00f6n\u00edt\u00e9se genomikus adatok felhaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1val<\/strong><\/span><\/p>\n

\u00a0L<\/strong>e\u00edr\u00e1s:<\/strong> A rosszindulat\u00fa daganatos betegs\u00e9gek kezel\u00e9se sor\u00e1n kulcsfontoss\u00e1g\u00fa, hogy lehet\u0151leg olyan kezel\u00e9st alkalmazzunk, amelynek minim\u00e1lis a mell\u00e9khat\u00e1sa. Ez legk\u00f6nnyebben \u00fagy val\u00f3s\u00edthat\u00f3 meg, ha az \u00e1ltalunk v\u00e1lasztott g\u00e9n nem is expressz\u00e1l\u00f3dik norm\u00e1l sz\u00f6vetekben. Ezen g\u00e9nek azonos\u00edt\u00e1s\u00e1hoz nagy adatt\u00f6megeket elemz\u00fcnk bioinformatikai algoritmusokkal.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr. Bartha \u00c1ron<\/p>\n

El\u00e9rhet\u0151s\u00e9g:<\/strong> bartha.aron@med.semmelweis-univ.hu<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1rt ismeret:<\/strong> el\u0151ny az R-ben val\u00f3 programoz\u00e1si k\u00e9pess\u00e9g, de nem felt\u00e9tel<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s<\/strong>: MB BSc, OB MSc, IB MSc<\/p>\n

\n

Malignus \u00e9s eg\u00e9szs\u00e9ges sz\u00f6vetek proteom szint\u0171 elemz\u00e9se<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong>\u00a0A projekt c\u00e9lja meghat\u00e1rozni \u00e9s valid\u00e1lni azokat a malignus sz\u00f6vetekre specifikus feh\u00e9rj\u00e9ket, amelyek potenci\u00e1lis predikt\u00edv vagy prognosztikus biomarkerk\u00e9nt szolg\u00e1lhatnak. A kutat\u00e1s sor\u00e1n online el\u00e9rhet\u0151 adatb\u00e1zisok felhaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1val \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1sra ker\u00fclnek a norm\u00e1l \u00e9s a leggyakrabban el\u0151fordul\u00f3 daganatos sz\u00f6vetek a proteom szintj\u00e9n.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong>\u00a0Dr. Bartha \u00c1ron<\/p>\n

El\u00e9rhet\u0151s\u00e9g:<\/strong>\u00a0bartha.aron@semmelweis.hu<\/a><\/p>\n

T\u00e9ma jellege:<\/strong>\u00a0betegkapcsolat (mintagy\u0171jt\u00e9s, adatgy\u0171jt\u00e9s) \u00e9s\/vagy adatelemz\u00e9s<\/p>\n

 <\/p>\n

\n

A ter\u00e1pi\u00e1s v\u00e1lasz biomarkerei az onkol\u00f3gi\u00e1ban <\/strong><\/span><\/p>\n

\u00a0<\/strong>le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A predikt\u00edv biomarkerek a ter\u00e1pi\u00e1s v\u00e1lasz el\u0151rejelz\u00e9s\u00e9re szolg\u00e1lnak a kezel\u00e9s megkezd\u00e9se el\u0151tt. Az onkol\u00f3gi\u00e1ban jelenleg alkalmazott kezel\u00e9sek eset\u00e9ben kev\u00e9s predikt\u00edv biomarker \u00e1ll rendelkez\u00e9s\u00fcnkre, ez\u00e9rt c\u00e9lunk az, hogy nyilv\u00e1nosan el\u00e9rhet\u0151 g\u00e9nexpresszi\u00f3s adatokon alapul\u00f3 bioinformatikai elemz\u00e9s seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel \u00fajabb potenci\u00e1lis biomarker jel\u00f6lteket azonos\u00edtsunk.<\/p>\n

t\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr. Fekete J\u00e1nos Tibor<\/p>\n

el\u00e9rhet\u0151s\u00e9g:<\/strong> fekete.janos@med.semmelweis-univ.hu<\/a><\/p>\n

elv\u00e1rt ismeret:<\/strong> el\u0151ny az R-ben val\u00f3 programoz\u00e1si k\u00e9pess\u00e9g, de nem felt\u00e9tel<\/p>\n

meghirdet\u00e9s:<\/strong> MB BSc, IB MSc<\/p>\n

\n

Mut\u00e1ci\u00f3k transzkriptomikus hat\u00e1s\u00e1nak vizsg\u00e1lata szolid tumorokban<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A mut\u00e1ci\u00f3k g\u00e9nexpresszi\u00f3ra gyakorolt hat\u00e1s\u00e1nak meg\u00e9rt\u00e9se a rosszindulat\u00fa daganatos betegs\u00e9gekben egy meglehet\u0151sen \u00f6sszetett feleadat. Egyes esetekben a mut\u00e1ci\u00f3knak nincsen k\u00f6zvetlen hat\u00e1sa a daganatos betegek t\u00fal\u00e9l\u00e9sre, azonban a mut\u00e1ci\u00f3 \u00e1ltal befoly\u00e1solt g\u00e9nexpresszi\u00f3s v\u00e1ltoz\u00e1sok sz\u00e1mos daganatt\u00edpus eset\u00e9n jelent\u0151sen befoly\u00e1solj\u00e1k a betegek t\u00fal\u00e9l\u00e9s\u00e9t. Ezen g\u00e9nkifejez\u0151d\u00e9si v\u00e1ltoz\u00e1sok vizsg\u00e1lat\u00e1hoz teljes exom \u00e9s RNS szekven\u00e1l\u00e1si, valamint microarray adatokat haszn\u00e1lunk fel.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Prof. Dr. Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs<\/p>\n

Az ide\u00e1lis hallgat\u00f3:<\/strong> medikus\/biol\u00f3gus\/biom\u00e9rn\u00f6k\/bioinikus<\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok: <\/strong>bioinformatikai \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> gyorffy.balazs@med.semmelweis-univ.hu<\/a><\/p>\n

\n

Mesters\u00e9ges intelligenci\u00e1n alapul\u00f3 algoritmusok alkalmaz\u00e1sa klinikai adatok elemz\u00e9s\u00e9re<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A rutin klinikai vizsg\u00e1latok sor\u00e1n hatalmas, ak\u00e1r t\u00f6bb sz\u00e1z param\u00e9tert tartalmaz\u00f3 heterog\u00e9n adathalmaz keletkezik minden p\u00e1ciensr\u0151l, azonban ezek \u00e9rtelmez\u00e9se m\u00e9ret\u00fckb\u0151l kifoly\u00f3lag nem rutinfeladat. A megfelel\u0151 bioinformatikai eszk\u00f6z\u00f6k azonban lehet\u0151v\u00e9 teszik ezen adatok diagnosztikai illetve prognosztikai c\u00e9l\u00fa kiakn\u00e1z\u00e1s\u00e1t. C\u00e9lunk a mesters\u00e9ges intelligencia alap\u00fa m\u00e9lytanul\u00e1si algoritmusok alkalmaz\u00e1sa klinikai adatok integr\u00e1l\u00e1s\u00e1ra illetve \u00faj lehets\u00e9ges biomarkerek felt\u00e9rk\u00e9pez\u00e9s\u00e9re.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr. Menyhart Ot\u00edlia<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> menyhart.otilia@med.semmelweis-univ.hu<\/a><\/p>\n

\n

\u00a0Izoterm\u00e1lis nukleinsav m\u00e9r\u00e9si technol\u00f3gi\u00e1k info-bionikai fejleszt\u00e9se<\/span><\/strong><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A COVID-19 j\u00e1rv\u00e1ny nagyban felgyors\u00edtotta a kutat\u00e1si szint\u0171 technol\u00f3gi\u00e1k diagnosztikai alkalmaz\u00e1s\u00e1t. P\u00e9lda erre az izoterm\u00e1lis DNS amplifik\u00e1ci\u00f3s technol\u00f3gi\u00e1k (pl LAMP-PCR) diagnosztikai megjelen\u00e9se. A technol\u00f3gia lehet\u0151v\u00e9 teszi a beteg\u00e1gy melletti (POCT: point-of-care) nukleinsav meghat\u00e1roz\u00e1st olyan lehet\u0151s\u00e9geket nyitva meg a diagnosztikai fejleszt\u00e9seknek amelyek kor\u00e1bban nem voltak el\u00e9rhet\u0151ek.\u00a0<\/p>\n

Az \u00f6n\u00e1ll\u00f3 laborat\u00f3riumi munka sor\u00e1n a hallgat\u00f3 a LAMP PCR technol\u00f3gi\u00e1hoz kapcsol\u00f3d\u00f3 fejleszt\u00e9si tev\u00e9kenys\u00e9gekbe fog bekapcsol\u00f3dni, pl primer tervez\u00e9s szoftveres t\u00e1mogat\u00e1sa, g\u00e9npanelekhez oligotervez\u00e9s, mikro RNS detekt\u00e1l\u00e1s izoterm\u00e1lis PCR technik\u00e1kkal.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr B\u00e1lint B\u00e1lint L\u00e1szl\u00f3, habilit\u00e1lt egyetemi adjunktus<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> balintblaszlo@gmail.com<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, diagnosztikai t\u00e9ma ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R\/Python programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s:<\/strong> molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 a orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc), \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

Kromatin szint\u0171 g\u00e9nexpresszi\u00f3 szab\u00e1lyoz\u00e1s onkogenomikai alkalmaz\u00e1sai<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> Az elm\u00falt \u00e9vt\u00edzed sor\u00e1n nagy mennyis\u00e9g\u0171 onkogenomikai adat v\u00e1lt nyilv\u00e1nosan el\u00e9rhet\u0151v\u00e9. Az adatok feldolgoz\u00e1sa folyamatos. A g\u00e9nexpresszi\u00f3 szab\u00e1lyoz\u00e1sban szerepet j\u00e1tsz\u00f3 kromatin szint\u0171 adatok feldolgoz\u00e1sa csak r\u00e9szben t\u00f6rt\u00e9nt meg.\u00a0<\/p>\n

Az \u00f6n\u00e1ll\u00f3 laborat\u00f3riumi munka sor\u00e1n a hallgat\u00f3 g\u00e9nexpresszi\u00f3s \u00e9s kromatin szint\u0171 adatok integr\u00e1l\u00e1s\u00e1t fogja elv\u00e9gezni. A feladat adat elemz\u00e9s \u00e9s integr\u00e1l\u00e1s, h\u00e1l\u00f3zatbiol\u00f3giai alap\u00fa kapcsolatok t\u00e9rk\u00e9pez\u00e9se \u00e9s nyers adatokb\u00f3l tov\u00e1bbi relev\u00e1ns kromatin szint\u0171 g\u00e9nexpresszi\u00f3 szab\u00e1lyoz\u00e1st \u00e9rint\u0151 adatok kinyer\u00e9se.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr B\u00e1lint B\u00e1lint L\u00e1szl\u00f3, habilit\u00e1lt egyetemi adjunktus<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> balintblaszlo@gmail.com<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, onkol\u00f3giai t\u00e9ma ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R\/Python programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s<\/strong>: molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 a orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc), \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

\u00a0Onkol\u00f3giai betegprofilok a szem\u00e9lyreszabott klinikai d\u00f6nt\u00e9shozatalhoz<\/span><\/strong><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> Az elm\u00falt \u00e9vt\u00edzed sor\u00e1n nagy mennyis\u00e9g\u0171 onkobiol\u00f3giai adat ker\u00fclt r\u00f6gz\u00edt\u00e9sre, \u00faj ter\u00e1pi\u00e1k jelentek meg \u00e9s folyamatosan k\u00f6zelebb ker\u00fcl\u00fcnk ahhoz, hogy a daganat egy kr\u00f3nikus betegs\u00e9gnek legyen tekinthet\u0151.<\/p>\n

Az \u00f6n\u00e1ll\u00f3 laborat\u00f3riumi munka sor\u00e1n a hallgat\u00f3 onkol\u00f3giai beteg profilokat fog meghat\u00e1rozni a rendelkez\u00e9sre \u00e1ll\u00f3 nyilv\u00e1nos adatszettek alapj\u00e1n. A profil felv\u00e9tel sor\u00e1n a beteg sz\u00e1m\u00e1ra inform\u00e1ci\u00f3 \u00e1tad\u00e1s is t\u00f6rt\u00e9nik. C\u00e9l, hogy a betegek kiszolg\u00e1ltatotts\u00e1g\u00e1t \u00e9s ez\u00e1ltal szorong\u00e1s\u00e1t cs\u00f6kkents\u00fck, az orvos-beteg kapcsolatot meger\u0151s\u00edts\u00fck, a kezel\u00e9shez val\u00f3 adherenci\u00e1t jav\u00edtsuk \u00e9s olyan \u00e9letviteli d\u00f6nt\u00e9sek meghozatal\u00e1hoz seg\u00edts\u00fck hozz\u00e1 melyek jav\u00edtj\u00e1k a gy\u00f3gyul\u00e1s es\u00e9ly\u00e9t \u00e9s az \u00e9letmin\u0151s\u00e9g roml\u00e1s\u00e1t megel\u0151zik.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr B\u00e1lint B\u00e1lint L\u00e1szl\u00f3, habilit\u00e1lt egyetemi adjunktus<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> balintblaszlo@gmail.com<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, onkol\u00f3giai t\u00e9ma ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R\/Python programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s: molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 a orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc), \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

Auton\u00f3m idegrendszer aktivit\u00e1s\u00e1nak becsl\u00e9se elektrofiziol\u00f3giai adatokb\u00f3l \u00e9s jelent\u0151s\u00e9ge onkol\u00f3giai d\u00f6nt\u00e9shozatalban<\/span><\/strong><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> Az elm\u00falt \u00e9vt\u00edzed sor\u00e1n nagy mennyis\u00e9g\u0171 hum\u00e1n biol\u00f3giai adat ker\u00fclt r\u00f6gz\u00edt\u00e9sre. Az auton\u00f3m idegrendszer aktivit\u00e1sa a l\u00e9gz\u00e9si aritmia m\u00e9rt\u00e9ke alapj\u00e1n becs\u00fclhet\u0151 EKG adatokb\u00f3l.<\/p>\n

Az \u00f6n\u00e1ll\u00f3 laborat\u00f3riumi munka sor\u00e1n a hallgat\u00f3 ny\u00edlv\u00e1nosan el\u00e9rhet\u0151 EKG \u00e9s egy\u00e9b elektrofiziol\u00f3giai adatok alapj\u00e1n fogja az auton\u00f3m idegrendszer \u00e9letkor szerinti variabilit\u00e1s\u00e1t vizsg\u00e1lni. A projekt c\u00e9lja azon onkol\u00f3giai betegek azonos\u00edt\u00e1sa akik eset\u00e9ben a kieg\u00e9sz\u00edt\u0151 szupport\u00edv kezel\u00e9sek magasabb hat\u00e9konys\u00e1ggal jav\u00edthatj\u00e1k az \u00e9letmin\u0151s\u00e9get.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr B\u00e1lint B\u00e1lint L\u00e1szl\u00f3, habilit\u00e1lt egyetemi adjunktus<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> balintblaszlo@gmail.com<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, onkol\u00f3giai t\u00e9ma ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R\/Python programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s:<\/strong> molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 a orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc), \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

Megoldatlan orvos biol\u00f3giai probl\u00e9m\u00e1kra megold\u00e1si javaslatok azonos\u00edtsa \u00e9s prototipiz\u00e1l\u00e1sa<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> Az elm\u00falt k\u00e9t \u00e9vt\u00edzed orvosbiol\u00f3giai adatb\u0151s\u00e9ge alapvet\u0151en megv\u00e1ltoztatta a hum\u00e1nbiol\u00f3giai tud\u00e1sunkat. Jelent\u0151s sz\u00e1m\u00fa \u00faj ter\u00e1pi\u00e1s \u00e9s diagnosztikai fejleszt\u00e9s v\u00e1lt el\u00e9rhet\u0151v\u00e9 \u00e9s tov\u00e1bbi megold\u00e1sok kidolgoz\u00e1s\u00e1ra van lehet\u0151s\u00e9g.<\/p>\n

Az \u00f6n\u00e1ll\u00f3 laborat\u00f3rium sor\u00e1n a hallgat\u00f3 a rendelkez\u00e9sre \u00e1ll\u00f3 genomikai adatok alapj\u00e1n fog azonos\u00edtani \u00e9s prototipz\u00e1lni olyan megold\u00e1si javaslatokat amelyek a jelenleg haszn\u00e1lt eszk\u00f6zrendszerek hat\u00e9konys\u00e1g\u00e1t meghaladj\u00e1k. T\u00e9mater\u00fcletek onkol\u00f3gia \u00e9s immun-onkol\u00f3gia.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr B\u00e1lint B\u00e1lint L\u00e1szl\u00f3, habilit\u00e1lt egyetemi adjunktus<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> balintblaszlo@gmail.com<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok<\/strong>: kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, az R\/Python programnyelv alapszint\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s:<\/strong> molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 a orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc), \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

Tudom\u00e1nyos webszerverek fejleszt\u00e9se<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A tudom\u00e1nyos eredm\u00e9nyek megjelen\u00edt\u00e9se a weben, k\u00fcl\u00f6n\u00f6sen a bioinformatika ter\u00fclet\u00e9n ma m\u00e1r egy k\u00fcl\u00f6n tudom\u00e1nyter\u00fclet. Sz\u00e1mos keretrendszert dolgoztak ki, amelyek haszn\u00e1lata seg\u00edti a fejleszt\u0151ket a gyors \u00e9s hat\u00e9kony back-end \u00e9s front-end fejleszt\u00e9sekben. Az \u00f6nlab sor\u00e1n egy php alap\u00fa keretrendszer elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1sa \u00e9s ezen kereszt\u00fcl egy tudom\u00e1nyos weboldal fejleszt\u00e9s\u00e9re ker\u00fcl sor.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr. Tusn\u00e1dy G\u00e1bor, tudom\u00e1nyos f\u0151munkat\u00e1rs<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> tusnady.gabor@ttk.hu<\/a><\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> kutat\u00e1s-fejleszt\u00e9s \u00e9s bioinformatika ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, PHP programnyelv alapszint\u0171 ismerete, MySQL alapsz\u00ednt\u0171 ismerete<\/p>\n

Meghirdet\u00e9s:<\/strong> molekul\u00e1ris bionikusok (BSc) \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

(Sejt)Felsz\u00ednes bioinformatikai kutat\u00e1s<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s:<\/strong> A sejt plazmamembr\u00e1nj\u00e1ban tal\u00e1lhat\u00f3 feh\u00e9rj\u00e9k, nemcsak a sejt port\u00e1rsai, hanem ezen feh\u00e9rj\u00e9k k\u00fclvil\u00e1g fel\u00e9 es\u0151 szegmensei adj\u00e1k a sejtek ujjlenyomat\u00e1t, ami alapj\u00e1n a sejtek identifik\u00e1lhat\u00f3ak. A feladat a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 proteomikai \u00e9s transzkriptomikai adatok, valamint a kutat\u00f3csoportunk \u00e1ltal fel\u00e1ll\u00edtott UniTmp adatb\u00e1zis adatinak felhaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1val egy olyan eszk\u00f6z el\u0151\u00e1ll\u00edt\u00e1sa, amely egy felhaszn\u00e1l\u00f3 \u00e1ltal megadott g\u00e9nlista alapj\u00e1n meghat\u00e1rozza, melyek azok a sejtfelsz\u00edni feh\u00e9rj\u00e9k a g\u00e9nlist\u00e1ban, amelyek m\u00e1s emberi sz\u00f6vetek sejtjeinek felsz\u00edn\u00e9n nem tal\u00e1lhat\u00f3k meg. Egy ilyen eszk\u00f6z el\u0151\u00e1ll\u00edt\u00e1sa \u00f3ri\u00e1si seg\u00edts\u00e9get ny\u00fajt ak\u00e1r r\u00e1kos, vagy m\u00e1s betegs\u00e9gek biomarker kutat\u00e1s\u00e1ban \u00e9s gy\u00f3gy\u00edt\u00e1s\u00e1ban.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/strong> Dr. Tusn\u00e1dy G\u00e1bor, tudom\u00e1nyos f\u0151munkat\u00e1rs<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm:<\/strong> tusnady.gabor@ttk.hu<\/p>\n

Elv\u00e1r\u00e1sok:<\/strong> bioinformatika \u00e9s szerkezeti biol\u00f3giai ir\u00e1nti \u00e9rdekl\u0151d\u00e9s, linux oper\u00e1ci\u00f3s rendszer alapszint\u0171 haszn\u00e1lata<\/p>\n

Megh\u00edrdet\u00e9s:<\/strong> molekul\u00e1ris bionikusok (BSc),\u00a0 orvos-biotechnol\u00f3gusok (MSc) \u00e9s info-bionikusok (MSc)\u00a0<\/p>\n

\n

\u00d6sszehasonl\u00edt\u00f3 genomikai \u00e9s transzkriptomikai vizsg\u00e1lat tumoros ikerp\u00e1rokban<\/strong><\/span><\/p>\n

Le\u00edr\u00e1s: <\/strong>A kutat\u00e1s c\u00e9lja, hogy bioinformatikai eszk\u00f6z\u00f6k seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel \u00f6sszehasonl\u00edtsuk tumoros ikerp\u00e1rok genomikai \u00e9s transzkriptomikai jellemz\u0151it, hogy m\u00e9lyebb betekint\u00e9st nyerj\u00fcnk a r\u00e1k molekul\u00e1ris folyamatainak h\u00e1tter\u00e9be. Az \u00d6NLAB-t\u00e9ma sor\u00e1n a hallgat\u00f3k komplex bioinformatikai anal\u00edzist v\u00e9geznek az \u00fajgener\u00e1ci\u00f3s szekven\u00e1l\u00e1sb\u00f3l nyert adatokon, bele\u00e9rtve a mut\u00e1ci\u00f3k azonos\u00edt\u00e1s\u00e1t, a struktur\u00e1lis vari\u00e1ci\u00f3k elemz\u00e9s\u00e9t \u00e9s a g\u00e9nexpresszi\u00f3s mint\u00e1zatok felt\u00e9rk\u00e9pez\u00e9s\u00e9t, mi\u00e1ltal j\u00e1rtass\u00e1got nyernek az adatelemz\u0151 folyamatok \u00fatveszt\u0151iben. A v\u00e9gs\u0151 c\u00e9l a heterog\u00e9n genetikai jellemz\u0151k felt\u00e1r\u00e1sa mellett a bioinformatikai elemz\u00e9sek sor\u00e1n haszn\u00e1lt elemz\u0151 l\u00e9p\u00e9sek \u00f6sszehasonl\u00edt\u00e1sa \u00e9s \u00e9rt\u00e9kel\u00e9se.<\/p>\n

T\u00e9mavezet\u0151:<\/b> Dr. Munk\u00e1csy Gy\u00f6ngyi egyetemi adjunktus, SE Bioinformatika Tansz\u00e9k<\/p>\n

Jelentkez\u00e9si c\u00edm: <\/strong>munkacsy.gyongyi@med.semmelweis-univ.hu<\/a>, mungyon@yahoo.com<\/p>\n

Sz\u00fcks\u00e9ges ismeretek<\/strong>: a genetika alapjainak ismerete, az R programnyelv alapszint\u0171 ismerete, Galaxy haszn\u00e1lat\u00e1ban val\u00f3 j\u00e1rtass\u00e1g el\u0151ny, de nem felt\u00e9tel<\/p>\n

Megh\u00edrdet\u00e9s:<\/strong> biom\u00e9rn\u00f6k\/bionika MSc<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

P\u00e1zm\u00e1ny P\u00e9ter Katolikus Egyetem Inform\u00e1ci\u00f3s Technol\u00f3giai \u00e9s Bionikai Karon meghirdetett \u00d6NLAB t\u00e9m\u00e1k:   Tumoros \u00e9s norm\u00e1l sz\u00f6vetek elk\u00fcl\u00f6n\u00edt\u00e9se genomikus adatok felhaszn\u00e1l\u00e1s\u00e1val \u00a0Le\u00edr\u00e1s: A rosszindulat\u00fa daganatos betegs\u00e9gek kezel\u00e9se sor\u00e1n kulcsfontoss\u00e1g\u00fa, hogy lehet\u0151leg olyan kezel\u00e9st alkalmazzunk, amelynek minim\u00e1lis a mell\u00e9khat\u00e1sa. Ez legk\u00f6nnyebben \u00fagy val\u00f3s\u00edthat\u00f3 meg, ha az \u00e1ltalunk v\u00e1lasztott g\u00e9n nem is expressz\u00e1l\u00f3dik norm\u00e1l sz\u00f6vetekben. Ezen g\u00e9nek …<\/p>\n","protected":false},"author":101779,"featured_media":0,"parent":8780,"menu_order":1,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-7287","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/7287","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/users\/101779"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=7287"}],"version-history":[{"count":11,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/7287\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10144,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/7287\/revisions\/10144"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/8780"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=7287"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=7287"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=7287"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}