{"id":6521,"date":"2020-01-29T17:11:15","date_gmt":"2020-01-29T16:11:15","guid":{"rendered":"http:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/?page_id=6521"},"modified":"2025-01-28T15:44:03","modified_gmt":"2025-01-28T14:44:03","slug":"kurzusadatok-es-kovetelmenyek-2","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/oktatas\/kurzusadatok-es-kovetelmenyek-2\/","title":{"rendered":"Adatok \u00e1br\u00e1zol\u00e1sa a bioinformatik\u00e1ban \u00e9s a rendszerbiol\u00f3gi\u00e1ban t\u00e1rgy"},"content":{"rendered":"<p><strong>Semmelweis Egyetem, \u00c1ltal\u00e1nos Orvostudom\u00e1nyi Kar<\/strong><br \/>\n<strong>A gesztorint\u00e9zet (\u00e9s az esetleges k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u0151 int\u00e9zetek) megnevez\u00e9se:<\/strong><br \/>\nSemmelweis Egyetem \u00c1OK, Bioinformatika Tansz\u00e9k<br \/>\n<strong>K\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u0151 int\u00e9zm\u00e9ny:<\/strong> PPKE Inform\u00e1ci\u00f3s Technol\u00f3giai \u00e9s Bionikai Kar<\/p>\n<p><strong>A t\u00e1rgy neve:<\/strong> Adatok \u00e1br\u00e1zol\u00e1sa a bioinformatik\u00e1ban \u00e9s a rendszerbiol\u00f3gi\u00e1ban<br \/>\n<strong>Angol nyelven:<\/strong> Data Visualization in Systems Biology and Bioinformatics<br \/>\n<strong>N\u00e9met nyelven:<\/strong> Datenvisualisierung in Systemsbiologie und in Bioinformatics <br \/>\n<strong>Kredit\u00e9rt\u00e9ke:<\/strong> 1 <br \/>\n<strong>Teljes \u00f3rasz\u00e1m:<\/strong> 30 \u00f3ra el\u0151ad\u00e1s: 15 \u00f3ra gyakorlat: 15 \u00f3ra szemin\u00e1rium: 0<br \/>\n<strong>Tant\u00e1rgy t\u00edpusa:<\/strong> k\u00f6telez\u0151 k\u00f6telez\u0151en v\u00e1laszthat\u00f3 szabadon v\u00e1laszthat\u00f3<br \/>\n<strong>Tan\u00e9v:<\/strong> II. f\u00e9l\u00e9v<\/p>\n<p>\n<strong>A tant\u00e1rgy oktat\u00e1s\u00e1nak c\u00e9lkit\u0171z\u00e9se, helye az orvosk\u00e9pz\u00e9s kurrikulum\u00e1ban:<\/strong><\/p>\n<p>A m\u00e9r\u00e9si adatok \u00e9s komplex eredm\u00e9nyek \u00e1br\u00e1zol\u00e1sa az orvosi \u00e9s \u00e9lettudom\u00e1nyi vizsg\u00e1latok sor\u00e1n egy \u00faj t\u00edpus\u00fa probl\u00e9mak\u00e9nt jelentek meg. Hogyan k\u00e9sz\u00edts\u00fcnk hat\u00e9kony k\u00e9pi bemutat\u00e1st a numerikus vagy sz\u00f6veges adatokb\u00f3l kiindulva? Hogy s\u0171r\u00edts\u00fcnk nagymennyis\u00e9g\u0171 adatot, vagy egy mint\u00e1zatot, illetve egy megjelen\u00edtend\u0151 trendet egyetlen k\u00e9pbe t\u00f6bb ezer vagy milli\u00f3 adatpont eset\u00e9n? A tant\u00e1rgy keretein bel\u00fcl szekvenci\u00e1k, genomok, klinikai m\u00e9r\u00e9si \u00e9s ut\u00e1nk\u00f6vet\u00e9si adatok, metagenomok, g\u00e9nexpresszi\u00f3, feh\u00e9rj\u00e9k 3D-s szerkezete, DNS, biol\u00f3giai h\u00e1l\u00f3zatok, popul\u00e1ci\u00f3s vizsg\u00e1latok \u00e9s agyi h\u00e1l\u00f3zatok ter\u00fclet\u00e9re f\u00f3kusz\u00e1lunk. Az oktat\u00e1s c\u00e9lja, hogy egy olyan tud\u00e1st adjon a hallgat\u00f3k kez\u00e9be, amellyel egyr\u00e9szt a rendelkez\u00e9sre \u00e1ll\u00f3 eszk\u00f6z\u00f6k k\u00f6z\u00fcl tudnak v\u00e1lasztani, m\u00e1sr\u00e9szt viszont ismerik ezen eszk\u00f6z\u00f6k el\u0151nyeit \u00e9s h\u00e1tr\u00e1nyait is. A oktat\u00e1s megszervez\u00e9s\u00e9t a Semmelweis, a PPKE \u00e9s a BME \u00e1ltal k\u00f6z\u00f6sen elnyert az EFOP-3.6.2-16 p\u00e1ly\u00e1zat t\u00e1mogatja.<\/p>\n<p>\n<strong>A t\u00e1rgy sikeres elv\u00e9gz\u00e9se milyen kompetenci\u00e1k megszerz\u00e9s\u00e9t eredm\u00e9nyezi:<\/strong><br \/>\nA hallgat\u00f3 k\u00e9pess\u00e9 v\u00e1lik az alapvet\u0151 adat\u00e1br\u00e1zol\u00e1si m\u00f3dszerek pontos alkalmaz\u00e1s\u00e1ra. Az egyes m\u00f3dszerek h\u00e1tr\u00e1nyait \u00e9s el\u0151nyeit ismeri, a kutat\u00e1si eredm\u00e9nyek \u00e9s a klinikai vizsg\u00e1latok \u00e9rtelmez\u00e9se sor\u00e1n a hib\u00e1kat felismeri.<\/p>\n<p><strong>A tant\u00e1rgy felv\u00e9tel\u00e9hez, illetve elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1s\u00e1hoz sz\u00fcks\u00e9ges el\u0151tanulm\u00e1nyi felt\u00e9tel(ek):<\/strong><br \/>\nSikeres els\u0151 4 szemeszter.<br \/>\n<strong>A kurzus megind\u00edt\u00e1s\u00e1nak hallgat\u00f3i l\u00e9tsz\u00e1mfelt\u00e9telei :<\/strong><br \/>\n<strong>Legkisebb hallgat\u00f3i l\u00e9tsz\u00e1m:<\/strong> 10<br \/>\n<strong>Legmagasabb hallgat\u00f3i l\u00e9tsz\u00e1m:<\/strong> 40<\/p>\n<p><strong>A kurzusra t\u00f6rt\u00e9n\u0151 jelentkez\u00e9s m\u00f3dja:<\/strong><br \/>\nNeptun regisztr\u00e1ci\u00f3, valamint a k\u00f6vetkez\u0151 oldalon:<br \/>\nhttps:\/\/efop362.itk.ppke.hu\/workshops\/data-visualization\/registration\/<\/p>\n<p><strong>A t\u00e1rgy r\u00e9szletes tematik\u00e1ja:<\/strong><\/p>\n<p><strong>I. Blokk: bevezet\u0151<\/strong><br \/>\n1. Bevezet\u0151 az adatvizualiz\u00e1l\u00e1sba, 1 \u00f3ra, Prof. Dr. Pongor S\u00e1ndor<br \/>\n2. Emberi \u00e9rz\u00e9kel\u00e9s \u00e9s az adatok vizualiz\u00e1l\u00e1sa, 1 \u00f3ra, Dr. Kov\u00e1cs Ilona<br \/>\n3. Gyakorlat: \u00e1ltal\u00e1nos adat\u00e1br\u00e1zol\u00e1s, 2 \u00f3ra, Dr. Ligeti Bal\u00e1zs<\/p>\n<p><strong>II. Blokk: Klinikai vizsg\u00e1latok eredm\u00e9nyeinek bemutat\u00e1sa<\/strong><br \/>\n1. V\u00e9gpontok alkalmaz\u00e1sa orvosbiol\u00f3giai vizsg\u00e1latokban, 1 \u00f3ra, Prof. Dr. Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs<br \/>\n2. Gyakorlat: Orvosbiol\u00f3giai adat\u00e1br\u00e1zol\u00e1s, 2 \u00f3ra, Dr. Menyh\u00e1rt Ot\u00edlia<\/p>\n<p><strong>IV. Blokk: Genom \u00e9s metagenom \u00e1br\u00e1zol\u00e1s<\/strong><br \/>\n1. A molekul\u00e1kt\u00f3l a genomon \u00e1t a metagenomhoz, 2 \u00f3ra, Prof. Dr. Pongor S\u00e1ndor<br \/>\n2. Gyakorlat: Genome \u00e9s metagenom \u00e1br\u00e1zol\u00e1s, 3 \u00f3ra, Dr. Juh\u00e1sz J\u00e1nos<\/p>\n<p><strong>III. Blokk: Transzkriptom \u00e1br\u00e1zol\u00e1s<\/strong><br \/>\n1. F\u00fcrtelemz\u00e9s (clustering), 1 \u00f3ra, Prof. Dr. Gy\u0151rffy Bal\u00e1zs<br \/>\n2. Gyakorlat: Legelterjedtebb t\u00e1vols\u00e1gmodellez\u0151 programok, 2 \u00f3ra, Dr. Bartha \u00c1ron<\/p>\n<p><strong>V. Blokk: Adath\u00e1l\u00f3zatok<\/strong><br \/>\n1. H\u00e1l\u00f3zatok fel\u00e9p\u00edt\u00e9se, 1 \u00f3ra, Prof. Dr. Pongor S\u00e1ndor<br \/>\n2. Gyakorlat: H\u00e1l\u00f3zat\u00e9p\u00edt\u0151 programok, 2 \u00f3ra, Dr. Ligeti Bal\u00e1zs<\/p>\n<p><strong>VI. Blokk: 3D modellek proteinek \u00e9s DNS \u00e1br\u00e1zol\u00e1s\u00e1ban<\/strong><br \/>\n1. Bevezet\u00e9s a 3D modellez\u00e9sbe, 2 \u00f3ra, Dr. G\u00e1sp\u00e1ri Zolt\u00e1n<br \/>\n2. Gyakorlat: Molekul\u00e1ris vizualiz\u00e1l\u00f3 programok, 2 \u00f3ra, Dr. Juh\u00e1sz J\u00e1nos, Dr. G\u00e1sp\u00e1ri Zolt\u00e1n<\/p>\n<p><strong>VII. Blokk: Popul\u00e1ci\u00f3 \u00e1br\u00e1zol\u00e1s<\/strong><br \/>\n1. \u00c1gens-alap\u00fa \u00e9s k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 egyenletek modellez\u00e9se, 2 \u00f3ra, Dr. Juh\u00e1sz J\u00e1nos<br \/>\n2. Gyakorlat: Popul\u00e1ci\u00f3 \u00e1br\u00e1zol\u00e1si programok, 2 \u00f3ra, Dr. Ligeti Bal\u00e1zs<\/p>\n<p><strong>VIII. Blokk: Agyi modellek<\/strong><br \/>\n1. Agyi h\u00e1l\u00f3zati \u00e1br\u00e1zol\u00e1s, 2 \u00f3ra, Prof. Dr. Ulbert Istv\u00e1n<br \/>\n2. Agyi vizualiz\u00e1l\u00e1si p\u00e9ld\u00e1k, 2 \u00f3ra, Prof. Dr. Ulbert Istv\u00e1n<\/p>\n<p><strong>Az adott tant\u00e1rgy hat\u00e1rter\u00fcleti k\u00e9rd\u00e9seit \u00e9rint\u0151 egy\u00e9b t\u00e1rgyak. A tematik\u00e1k lehets\u00e9ges \u00e1tfed\u00e9sei:<\/strong><br \/>\nBiofizika (biostatisztika), Radiol\u00f3gia, Transzl\u00e1ci\u00f3s medicina<\/p>\n<p><strong>A foglalkoz\u00e1sokon val\u00f3 r\u00e9szv\u00e9tel k\u00f6vetelm\u00e9nyei \u00e9s a t\u00e1volmarad\u00e1s p\u00f3tl\u00e1s\u00e1nak lehet\u0151s\u00e9ge:<\/strong><br \/>\nP\u00f3tl\u00e1sra nincs lehet\u0151s\u00e9g<\/p>\n<p><strong>A f\u00e9l\u00e9v al\u00e1\u00edr\u00e1s\u00e1nak k\u00f6vetelm\u00e9nyei:<\/strong> <br \/>\nAz el\u0151ad\u00e1sokr\u00f3l \u00e9s gyakorlatokr\u00f3l t\u00f6rt\u00e9n\u0151 t\u00e1volmarad\u00e1sok sz\u00e1ma nem lehet t\u00f6bb a f\u00e9l\u00e9v gyakorlatainak 25%-\u00e1n\u00e1l.<\/p>\n<p><strong>A vizsga t\u00edpusa: <\/strong>F\u00e9l\u00e9vk\u00f6zi jegy<\/p>\n<p><strong>Vizsgak\u00f6vetelm\u00e9nyek:<\/strong><br \/>\n60%-ra teljes\u00edtett teszt (60% alatt: nem megfelelt, 60-80%: megfelelt, 80% felett: kiv\u00e1l\u00f3an megfelelt)<\/p>\n<p><strong>Az oszt\u00e1lyzat kialak\u00edt\u00e1s\u00e1nak m\u00f3dja \u00e9s t\u00edpusa:<\/strong><br \/>\nTesztk\u00e9rd\u00e9sek \u00e9s feladatok helyes megold\u00e1s\u00e1nak ar\u00e1nya alapj\u00e1n.<\/p>\n<p><strong>A vizsg\u00e1ra t\u00f6rt\u00e9n\u0151 jelentkez\u00e9s m\u00f3dja:<\/strong><br \/>\nNeptun<\/p>\n<p><strong>A vizsga megism\u00e9tl\u00e9s\u00e9nek lehet\u0151s\u00e9gei:<\/strong><br \/>\nKett\u0151 alkalommal \u00fajabb teszt form\u00e1j\u00e1ban<\/p>\n<p><strong>A tananyag elsaj\u00e1t\u00edt\u00e1s\u00e1hoz felhaszn\u00e1lhat\u00f3 nyomtatott, elektronikus \u00e9s online jegyzetek, tank\u00f6nyvek, seg\u00e9dletek \u00e9s szakirodalom:<\/strong><br \/>\nAz el\u0151ad\u00e1son elhangzott ismeretek.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Semmelweis Egyetem, \u00c1ltal\u00e1nos Orvostudom\u00e1nyi Kar A gesztorint\u00e9zet (\u00e9s az esetleges k\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u0151 int\u00e9zetek) megnevez\u00e9se: Semmelweis Egyetem \u00c1OK, Bioinformatika Tansz\u00e9k K\u00f6zrem\u0171k\u00f6d\u0151 int\u00e9zm\u00e9ny: PPKE Inform\u00e1ci\u00f3s Technol\u00f3giai \u00e9s Bionikai Kar A t\u00e1rgy neve: Adatok \u00e1br\u00e1zol\u00e1sa a bioinformatik\u00e1ban \u00e9s a rendszerbiol\u00f3gi\u00e1ban Angol nyelven: Data Visualization in Systems Biology and Bioinformatics N\u00e9met nyelven: Datenvisualisierung in Systemsbiologie und in Bioinformatics Kredit\u00e9rt\u00e9ke: 1 &hellip;<\/p>\n","protected":false},"author":101688,"featured_media":0,"parent":6503,"menu_order":2,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"_acf_changed":false,"footnotes":""},"categories":[],"tags":[],"class_list":["post-6521","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/6521","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/users\/101688"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=6521"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/6521\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":10840,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/6521\/revisions\/10840"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/6503"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=6521"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=6521"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/semmelweis.hu\/bioinformatika\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=6521"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}